| 查看: 1361 | 回复: 3 | |||
mine2mine金虫 (小有名气)
|
[交流]
求助！！关于蛋白序列和转录组数据比对
|
| 之前在实验室分到了一个蛋白，做了肽指纹图谱PMF，拿到了三个氨基酸序列，但是都不大，不到20 kD。我想拿到这个蛋白的全序列或者CDS序列。因为NCBI上有该物种的转录组数据库，因此我想用蛋白序列与NCBI里的SRA转录组数据进行tblastn比对。但是没有比对出结果。我想知道我的这个思路是否可行？没有结果是由哪些原因导致的？是氨基酸序列不够长还是MAlDI-MSMS做的这个PMF序列不太可信呢？还是其他原因？鉴于我的这种情况，有没有更好的方法来达到我的目的，拿到这个蛋白的氨基酸/基因序列？ |
回复此楼» 猜你喜欢
材料调剂
已经有7人回复
-
化学工程085602 305分求调剂
已经有10人回复
-
289求调剂
已经有15人回复
-
291 求调剂
已经有7人回复
-
274求调剂
已经有14人回复
-
北京林业大学硕导招生广告
已经有3人回复
-
309求调剂
已经有5人回复
-
292求调剂
已经有8人回复
-
求调剂
已经有4人回复
-
一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂
已经有3人回复
2楼2017-03-20 11:36:00
mine2mine
金虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1408.5
- 散金: 5
- 帖子: 207
- 在线: 145.4小时
- 虫号: 1831596
- 注册: 2012-05-23
- 性别: GG
- 专业: 中药药效物质
3楼2017-03-20 14:38:56
4楼2017-03-27 17:28:46
