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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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qac

金虫 (正式写手)

[交流] 请问怎么知道买来的蛋白或酶是什么结构啊

只知道在PDB(RCSB)网站上查,可是每次一个关键词查出来都有很多,不知道该选哪一个。

举个例子,比如木瓜蛋白酶,英文名是papain,在PDB上搜出来好多结果,有115个 structure hits,不知道该选哪一个了。有好多是papain和其他的结合物,还有好多是kinase,我知道查到之后可以对PDB文件用pymol看结构,可是不知道该选哪一个搜索结果,买来的样品瓶子上也没有详细的介绍。

真的把我搞晕了,望各位不吝赐教啊
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月月大可

木虫 (著名写手)


qac(金币+1,VIP+0):thanks
来源不同的同功酶,有些时候差别会很大。
8楼2008-12-31 08:37:19
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查看全部 8 个回答

feijicao

银虫 (正式写手)


qac(金币+1,VIP+0):谢谢
我也不会  帮你顶顶
2楼2008-12-26 11:45:30
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bioinflab

银虫 (小有名气)


qac(金币+1,VIP+0):谢谢,帮我再解答一下吧
最好的办法是利用蛋白或酶的氨基酸序列在PDB中做blast,如果有就可以找到
3楼2008-12-26 23:05:05
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月月大可

木虫 (著名写手)


qac(金币+1,VIP+0):谢谢,帮我再解答一下吧
找找 AA 的序列,在PDB或Swiss-Prot中比对都可以
4楼2008-12-26 23:09:34
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