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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 请问怎么知道买来的蛋白或酶是什么结构啊
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qac

金虫 (正式写手)

[交流] 请问怎么知道买来的蛋白或酶是什么结构啊

只知道在PDB(RCSB)网站上查，可是每次一个关键词查出来都有很多，不知道该选哪一个。

举个例子，比如木瓜蛋白酶，英文名是papain，在PDB上搜出来好多结果，有115个 structure hits，不知道该选哪一个了。有好多是papain和其他的结合物，还有好多是kinase，我知道查到之后可以对PDB文件用pymol看结构，可是不知道该选哪一个搜索结果，买来的样品瓶子上也没有详细的介绍。

真的把我搞晕了，望各位不吝赐教啊
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1楼 2008-12-26 10:52:41
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feijicao

银虫 (正式写手)
★
qac(金币+1,VIP+0):谢谢
我也不会  帮你顶顶
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2楼2008-12-26 11:45:30
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bioinflab

银虫 (小有名气)
★
qac(金币+1,VIP+0):谢谢，帮我再解答一下吧
最好的办法是利用蛋白或酶的氨基酸序列在PDB中做blast，如果有就可以找到
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3楼2008-12-26 23:05:05
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月月大可

木虫 (著名写手)
★
qac(金币+1,VIP+0):谢谢，帮我再解答一下吧
找找 AA 的序列，在PDB或Swiss-Prot中比对都可以
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4楼2008-12-26 23:09:34
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qac

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bioinflab at 2008-12-26 23:05:
最好的办法是利用蛋白或酶的氨基酸序列在PDB中做blast，如果有就可以找到

氨基酸序列？也是要去查吗，可是怎么才能知道是我买的酶的氨基酸序列呢
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5楼2008-12-27 09:18:41
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qac

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 月月大可 at 2008-12-26 23:09:
找找 AA 的序列，在PDB或Swiss-Prot中比对都可以

请问氨基酸序列是去NCBI上找吗，NCBI上搜索名字也有一大堆，不知道哪个才是我买的产品的AA序列
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6楼2008-12-27 09:20:48
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月月大可

木虫 (著名写手)
★
qac(金币+1,VIP+0):谢谢。来源物种不一样的蛋白差别很大吗。某种蛋白激酶和某种蛋白是一回事吗
酶的说明书上应该可以找到这种酶的来源，知道来源于那种生物，再在蛋白质数据库中搜素，一般数据库都会提供每种蛋白有个简单介绍，能找到来源的物种。
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7楼2008-12-29 10:35:45
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月月大可

木虫 (著名写手)
★
qac(金币+1,VIP+0):thanks
来源不同的同功酶，有些时候差别会很大。
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8楼2008-12-31 08:37:19
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