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xufund至尊木虫 (知名作家)
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ZINC15里的小分子结构如何下载
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| 最近不能打开老的zinc12，去新推出的zinc15网站转了一圈，结果发现在下载substances-subsets里boutique 的mol2格式时，只能下载7M大小。里面只有大约几百个化合物。感觉不对劲。有高手指点一下吗？谢谢 |
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你搞定了吗？ 我倒算会下，是在Linux下用wget下的；按它意思好像也能在Windows下下载，但我还没摸索出来。 不过下下来的是好多小的sdf（我选的sdf格式）文件，不是像zinc12那样比较大的文件。 发自小木虫Android客户端 |
2楼2017-04-17 13:50:38
xufund
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3楼2017-05-27 05:54:04
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4楼2017-06-20 11:23:42
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我下载的world.mol2文件用记事本打开后，显示如下： @<TRIPOS>MOLECULE ZINC000306122005 72 73 1 0 0 SMALL USER_CHARGES @<TRIPOS>ATOM 1 C1 -0.0837 1.7329 0.5863 C.3 1 ZINC000306122005 -0.1200 2 C2 -0.0874 0.2289 0.4901 C.2 1 ZINC000306122005 -0.0700 3 C3 0.5485 -0.4996 1.4086 C.2 1 ZINC000306122005 0.0200 4 N4 0.5953 -1.8928 1.3651 N.am 1 ZINC000306122005 -0.6500 5 C5 0.5790 -2.6344 0.2514 C.2 1 ZINC000306122005 0.5300 6 O6 0.5680 -2.1184 -0.8509 O.2 1 ZINC000306122005 -0.5100 7 C7 0.5750 -4.1422 0.3530 C.3 1 ZINC000306122005 0.1400 8 H8 -0.3598 -4.5213 -0.0611 H 1 ZINC000306122005 0.1400 9 C9 1.7542 -4.7168 -0.4308 C.3 1 ZINC000306122005 -0.0900 10 S10 3.0695 -3.4763 -0.5792 S.3 1 ZINC000306122005 -0.0900 11 S11 4.7096 -4.4462 0.1790 S.3 1 ZINC000306122005 -0.2100 12 C12 5.7529 -3.0837 0.7691 C.3 1 ZINC000306122005 -0.0600 13 C13 6.7415 -3.6065 1.8135 C.3 1 ZINC000306122005 -0.0800 14 C14 6.0700 -3.6334 3.1655 C.2 1 ZINC000306122005 -0.1300 15 C15 6.0717 -2.5648 3.9150 C.2 1 ZINC000306122005 -0.1900 16 C16 5.3901 -2.5109 5.2533 C.3 1 ZINC000306122005 0.1300 17 H17 5.9919 -1.9147 5.9439 H 1 ZINC000306122005 0.1000 18 C18 5.2135 -3.9152 5.8322 C.3 1 ZINC000306122005 -0.1400 19 C19 3.8283 -4.4244 5.5082 C.2 1 ZINC000306122005 0.5400 20 O20 3.1561 -4.9315 6.3781 O.2 1 ZINC000306122005 -0.5300 21 N21 3.3652 -4.2938 4.2555 N.am 1 ZINC000306122005 -0.7100 22 C22 2.0707 -4.8135 3.8132 C.3 1 ZINC000306122005 0.1400 23 H23 1.2876 -4.5092 4.4988 H 1 ZINC000306122005 0.1100 24 C24 2.1321 -6.3391 3.7247 C.3 1 ZINC000306122005 -0.1000 25 C25 0.7431 -6.8868 3.3909 C.3 1 ZINC000306122005 -0.1600 26 C26 3.1183 -6.7471 2.6284 C.3 1 ZINC000306122005 -0.1500 27 C27 1.8043 -4.2460 2.4399 C.2 1 ZINC000306122005 0.4900 28 O28 2.6240 -3.4893 1.9552 O.2 1 ZINC000306122005 -0.4900 29 N29 0.6775 -4.5509 1.7614 N.am 1 ZINC000306122005 -0.7300 30 O30 4.0865 -1.8881 5.0997 O.3 1 ZINC000306122005 -0.3400 31 C31 4.0387 -0.6346 4.6238 C.2 1 ZINC000306122005 0.4700 32 O32 5.0479 -0.0544 4.3004 O.2 1 ZINC000306122005 -0.4800 33 C33 2.6978 0.0542 4.5014 C.3 1 ZINC000306122005 0.1600 34 H34 2.8505 1.1121 4.2927 H 1 ZINC000306122005 0.1400 35 C35 1.9230 -0.1061 5.8111 C.3 1 ZINC000306122005 -0.1100 36 C36 2.7192 0.5249 6.9551 C.3 1 ZINC000306122005 -0.1500 37 C37 0.5660 0.5900 5.6894 C.3 1 ZINC000306122005 -0.1400 38 N38 1.9473 -0.5636 3.4089 N.am 1 ZINC000306122005 -0.7200 39 C39 1.2582 0.1826 2.5239 C.2 1 ZINC000306122005 0.5600 40 O40 1.2127 1.3927 2.6267 O.2 1 ZINC000306122005 -0.5100 41 H41 0.9430 2.0970 0.5467 H 1 ZINC000306122005 0.0800 42 H42 -0.6500 2.1515 -0.2457 H 1 ZINC000306122005 0.0600 43 H43 -0.5413 2.0379 1.5273 H 1 ZINC000306122005 0.0800 44 H44 -0.6049 -0.2589 -0.3226 H 1 ZINC000306122005 0.1400 45 H45 0.6179 -2.3601 2.2248 H 1 ZINC000306122005 0.3900 46 H46 2.1411 -5.5960 0.0871 H 1 ZINC000306122005 0.1100 47 H47 1.4181 -5.0087 -1.4274 H 1 ZINC000306122005 0.1200 48 H48 6.3051 -2.6597 -0.0702 H 1 ZINC000306122005 0.0900 49 H49 5.1265 -2.3123 1.2165 H 1 ZINC000306122005 0.0900 50 H50 7.0578 -4.6133 1.5451 H 1 ZINC000306122005 0.0900 51 H51 7.6092 -2.9484 1.8540 H 1 ZINC000306122005 0.0900 没有链接地址啊 |
5楼2017-06-21 20:53:16
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