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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 高聚物cross-linking的模拟
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shabeir

金虫 (小有名气)

[交流] 高聚物cross-linking的模拟

大家有做过高聚物cross-linking的模拟吗？我的体系cross-linking的比例是80%，但不确定哪些之间有cross-linking，需要从模拟无cross-linking到80%cross-linking的过程，这个怎么做比较高效？
我试着在没有cross-linking的情况下跑了一段MD，去看monomer之间的距离有没有可能cross-linking，但是失望的是，几乎没有几对达到要求的，这些做下去的话，很难达到80%的。大家有什么好的建议吗？
谢谢！
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iSimuLy

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1楼 2017-03-09 08:00:34
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iSimuLy

捐助贵宾 (正式写手)

资深专家顾问
★ ★
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送红花一朵
shabeir: 金币+1 2017-03-10 03:16:41
这个最好用MC吧；

或者高温跑
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2楼2017-03-09 19:26:24
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yujingui

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个应该在MS里先建立好一定比例的cross-linking, 或者要自己编程实现。
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3楼2017-03-11 03:49:03
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