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stinwind

木虫 (小有名气)

[求助] CASTEP金属表面吸附计算 已有2人参与

构建的3X3的Ni(111)表面,然后在上面放一个已经优化好结构的丙烯分子。将丙烯分子放到构建好的表面。丙烯两个双键端的碳原子分别和两个Ni接近,ms自动显示有键联。固定Ni表面,使用CASTEP计算构型优化。使用coarse精度。
但计算后发现丙烯分子向真空层方向去了,离Ni的表面更远了。按我的理解,应该形成稳定的吸附形式啊。

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zhangjiekm

银虫 (小有名气)

你好!因为我开始学习MS,非常抱歉:我不能回答你的问题,而是想请教你几个问题。
我在学习CASTEP中这个tutorial ("Adsorption of CO onto a Pd(110) surface“)有些疑惑:1、在计算Pd(110)时,采用的是其P1的模型;而在计算CO on Pd(110)时,采用了(find+impose symmetry)高对称性的模型,两者不需要保持一致性吗?2、采用高对称性的模型后,运算速度会得到提高,但是得到的最终能量相应也会有变化,这个变化值在模拟计算中是可以接受的吗?多谢!
2楼2017-03-09 22:58:53
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悟空传说

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
franch: 金币+2, 鼓励交流 2017-03-26 07:03:53
楼主把图贴上来看看,建议media就行
3楼2017-03-10 14:53:40
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訁礻

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
franch: 金币+3, 鼓励交流 2017-03-26 07:04:16
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangjiekm at 2017-03-09 22:58:53
你好!因为我开始学习MS,非常抱歉:我不能回答你的问题,而是想请教你几个问题。
我在学习CASTEP中这个tutorial ("Adsorption of CO onto a Pd(110) surface“)有些疑惑:1、在计算Pd(110)时,采用的是其P1 ...

重新寻找对称性,只是为了对最小重复单元的计算。MS用于模拟不是说什么结构是对的什么是错的,而是寻找更稳定的结构,吸附后的结构如果不对称,显然是较不稳定的。

发自小木虫Android客户端
4楼2017-03-23 15:54:47
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zhangfrank

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
stinwind(franch代发): 金币+4, 谢谢回帖交流 2017-03-26 07:04:30
楼主你初始的吸附原子跟表面的距离是多少?如果初始距离太远,是可能让吸附原子脱离表面的;
另外,你的真空多厚?如果真空太薄也可能有这个影响,被image吸附走了的
计算顺利点吧
5楼2017-03-25 10:02:14
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daixiujuan52

铜虫 (正式写手)

★ ★
franch: 金币+2, 鼓励交流 2017-03-26 07:04:42
真空层加大,精度加大

发自小木虫IOS客户端
6楼2017-03-25 10:20:09
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呆--呆

新虫 (初入文坛)

楼主,能不能请教一下相关问题,感激不尽啊。。
7楼2017-06-23 21:04:23
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