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19910716

新虫 (初入文坛)

[求助] autodock 已有2人参与

在autodock中运行autogid4时总是出现“the number of atom types found in the receptor PDBQT(7) does not match the number specified by the"  receptor  types "command(6) in the GPF
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longdlut

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应该是特殊原子吧,可以查看一下是否有金属原子。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2017-03-08 13:10:40
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19910716

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2017-03-08 13:10:40
应该是特殊原子吧,可以查看一下是否有金属原子。

没有金属原子,我运行的是G-四连体DNA和小分子配体,对于DNA不需要设置柔性残基吧?
3楼2017-03-08 15:19:10
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longdlut

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【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 19910716 at 2017-03-08 15:19:10
没有金属原子,我运行的是G-四连体DNA和小分子配体,对于DNA不需要设置柔性残基吧?...

不需要设置柔性残基
4楼2017-03-15 13:11:54
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fan5561777

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

您好,我在用autodock时,进行rungrid的时候选择autogrid.exe后总是提示不成功是什么原因啊?
5楼2017-04-18 20:28:20
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