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关于稀有密码子，求助！！！
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在稀有密码子分析网站上传了目的基因序列（1.5kb），分析发现含稀有密码子AGA约2.6%左右，而一般大肠杆菌的AGA出现频率为0.2%。除此之外，还有编码甘氨酸的稀有密码子GGA（约0.8%）。这些稀有密码子没有成串的在一块，基本上是分散在这个序列上（只有2个AGA连在一起）。 请问是否有必要采用稀有密码子表达菌株？或者利用简并性合成优化的密码子序列？ 刚接触这块内容，还不会分析结果，哪位有经验的帮帮忙吧，谢谢了！！ |
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5楼2008-12-23 20:36:35
6楼2008-12-23 20:46:06
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这是我用的序列，之前的文献报道有在大肠杆菌XL1-Blue中得到表达的。麻烦帮我看看呐，多谢了。 ATG AAG TTT TTC AAA AAC ACT TTA GCT TTA CTC ACC TTA GTC ATT GCT GGT TCA AAT GCT ATG AGA AAT ATT CCA TCC AAA GAT TTA GTT AAG GAA TTA AAC ATT GGT TGG AAT TTA GGT AAT GCT TTA GAT GCT CAT TGT TTA GAT AAA TTA GAT TAT AAT AAA GAT CAA CTT GCT TCT GAA ACT TGT TGG GCT AAT CCA AAG GCT ACT CCA GGA CTT TTC AGT GCA TTA AAG AAT CAA GGT TTT AAT GTT TTC CGT ATT CCA ACC ACT TGG ACC GGT CAC TTT GGT AAT GGT CCA GAT TAC AAA ATT AGT GAT GTT TGG ATG AGA AGA GTT CAT GAA GTT GTT GAT TAT GCT CTT AAC ACT GGA AGC TAC GTC ATC TTA AAT ATT CAC CAT GAA AAT TGG AAT TAT GCT TTC TCT AAC AAT TTA CAA AAG GCA AAA CCA ATT TTA GCT GCT ATC TGG AAA CAA ATT GCT GCT GAA TTC GCT AAC TAT GAT GAA CAT TTA ATT TTC GAA GGT ATG AAT GAA CCA AGA AAG GTT GAT CAT CCA AAT GAA TGG AAT GGT GGT GAC CAA GAA GGT TGG GAC TTC GTT AAT GAA ATG AAT GCT GTC TTC CTT CAA ACT GTT CGT GCC TCT GGT GGT AAC AAT GCT ATT CGT CAC CTT ATG ATT CCA ACT TAT GCT GCT TGT GTT AAC GAT GGT GCT CTT GAA TCT TAC GTT AGA AAA TTC CCA ACT AAT GAT AAT AAG GTT ATT GCT TCT GTC CAC TCT TAT GTT CCA TAT AAC TTT GCC TTA AAT ACT GGC GCC GGT GCT GAA AAG ACT TTC GGT TCC ACT AGC GAT ATT GAA TGG GCT ATG AAC AAC ATC AAG AGA TTC TTA GTT GAC AGA AAT ATT CCA GTT AUA ATT GGT GAA TTC GGA GCT ATG AAC CGT GAC AAT GAA TCT GAA CGT GCT AGA TGG GCT GAA TAC TAC ATT AAG AGT GCC ACT GCT ATG GGT GTT CCA TGT GTC TTA TGG GAT AAT GGT TAC ACT CAA GGT ACT GGT GAA CTT TTC GGT GTT ATT GAC CGT AAC TCT TAC AGA ATC ATT TTC CAA CAA TTC ATT AAT GGC TTA ATG AAG GGA TTA GGT GGT AAG AAG ACC GTT GCT CCA GCT CCA ACT ACT ACT ATT ACT ACT ACT ACT ACT GTT AAA GTT CAA CCA ACT AAT AAT AAT GAA TGT TTC AGT ACT AGA CTT GGT TAC AGC TGT TGT AAT GGT TGT GAT GTC TTT TAC ACT GAT AAT GAT GGT AAA TGG GGT GTT GAA AAC GGT AAC TGG TGT GGT ATT AAG TCA TCT TGT GAT AAC AAC CAA CGT TAT TGC TGG TCT GAA AGA CTT GGT TAC CCA TGT TGT CAA TAT ACC ACC AAT GTT GAA TAC ACC GAT AAT GAT GGT AGA TGG GGT GTT GAA AAT GGT AAC TGG TGT GGT ATT TAT TAA [ Last edited by 胡笳桃子 on 2008-12-23 at 22:48 ] |
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