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胡笳桃子

新虫 (小有名气)

[交流] 关于稀有密码子,求助!!!

在稀有密码子分析网站上传了目的基因序列(1.5kb),分析发现含稀有密码子AGA约2.6%左右,而一般大肠杆菌的AGA出现频率为0.2%。除此之外,还有编码甘氨酸的稀有密码子GGA(约0.8%)。这些稀有密码子没有成串的在一块,基本上是分散在这个序列上(只有2个AGA连在一起)。


请问是否有必要采用稀有密码子表达菌株?或者利用简并性合成优化的密码子序列?


刚接触这块内容,还不会分析结果,哪位有经验的帮帮忙吧,谢谢了!!
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胡笳桃子

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by zhaocy8903 at 2008-12-24 09:01:
等表达不出来再分析吧

是这样的,之前已经有文献做过表达,单纯重复应该没有什么意义吧。
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9楼2008-12-24 10:18:57
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胡笳桃子

新虫 (小有名气)

主要是这两个问题: 1、我这种情况,是否有必要采用稀有密码子优化策略?也就是说,更改密码子或更换表达菌株的必要前提或依据是什么?在什么情况下,会影响表达而必须考虑这个优化策略?

2、如果确定有必要在这个方面(稀有密码子)进行优化,是不是采用稀有密码子的表达菌株更方便也更有效呢?

谢谢解答!!!
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2楼2008-12-23 12:33:23
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jasco

木虫 (正式写手)


lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论~
1.没有必要优化
2.可以直接用稀有密码子的表达菌株来表达,
3楼2008-12-23 13:20:44
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胡笳桃子

新虫 (小有名气)

哦。好的,谢谢。请问什么状况下必须优化呢?
赠人玫瑰,手有余香。
4楼2008-12-23 18:25:43
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