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studentone

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何求CH4气体的自扩散系数 已有1人参与

自己利用MS8.0软件求甲烷气体的在一定温度和压力下的自扩散系数,过程如下:
  (1)利用amorphous cell 模块中的construction构建对应温度和压力下的体系:
    (2)用Forcite模块中的Dynamics进行动力学模拟;
      (3)对动力学模拟结果求MSD,再求扩散系数:
问题是:
  (1)Amorphous cell 中construction 和calculation都可以构建体系,到底用哪个?
    (2)在动力学模拟过程中,使用的是NPT系综,体系的密度一直在减小,温度不稳定,如图所示,为什么?

如何求CH4气体的自扩散系数
图1.jpg


如何求CH4气体的自扩散系数-1
图2.jpg
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studentone

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
2楼2017-03-02 20:55:55
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chuntao118

新虫 (著名写手)

软件不会,但是要是编程的话你可以参考《The Art of Molecular Dynamics Simulation》的第八章水分子的扩散系数计算!
3楼2017-03-03 08:29:57
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
studentone(abinitio代发): 金币+30, 感谢应助 2017-03-20 13:52:20
(1)Amorphous cell 中construction 和calculation都可以构建体系,到底用哪个?
回复:两个都可以用,只要能构建出模型即可,后者在参数设置上更为精细。

(2)在动力学模拟过程中,使用的是NPT系综,体系的密度一直在减小,温度不稳定,如图所示,为什么?
回复:确保力场适用,恒压、恒温器选用合适。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
4楼2017-03-03 09:25:47
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