24小时热门版块排行榜    

查看: 2683  |  回复: 5

djl315

铜虫 (小有名气)

[交流] 标定任意一个原子,进行原子追踪

请教各位,
1  怎么在lammps中标定一个原子,追踪原子轨迹,记录标定原子的坐标变化?
2  在lammps中用什么命令计算得到的数据能得到原子在扩散界面附近的浓度分布?如图所示
谢谢大家!

标定任意一个原子,进行原子追踪
1.PNG
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
2楼2017-03-01 20:54:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
祝福
3楼2017-03-01 21:07:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
4楼2017-03-01 21:37:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

缘自阳光

新虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
djl315: 金币+1 2017-03-02 09:40:52
1.#region head block 32.1 32.4 39.9 40.8 -354.5 -354.1  units box
#region tail block 100.4 100.5 23.8 25.3 -219.4 -219 units box                                       
#group left region head
#group right region tail
可以如上利用region 和group命令根据标定原子初始坐标,将标定原子设为特殊的group,之后在run中用dump 命令输出特殊group原子的坐标,也可以根据原子的种类,直接用group命令设定特殊group。
2.可以考虑输出所有原子的坐标,自己编个小程序在界面法线方向统计各原子分布。
5楼2017-03-01 22:00:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

djl315

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 缘自阳光 at 2017-03-01 22:00:14
1.#region head block 32.1 32.4 39.9 40.8 -354.5 -354.1  units box
#region tail block 100.4 100.5 23.8 25.3 -219.4 -219 units box                                       
#group left region head
#gro ...

非常感谢!
6楼2017-03-02 09:41:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 djl315 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 18:22 by 7huP8NPKZCp9
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 18:22 by 7huP8NPKZCp9
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 6/300 2026-08-15 18:18 by 7huP8NPKZCp9
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 6/300 2026-08-15 18:06 by 7huP8NPKZCp9
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 7/350 2026-08-15 17:58 by 7huP8NPKZCp9
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +11 archvillain 2026-08-15 20/1000 2026-08-15 17:47 by 医学老男孩
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 3/150 2026-08-15 12:41 by KxMI1BYBxWX1
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 HFw0lei2R37i 2026-08-14 9/450 2026-08-15 11:33 by KxMI1BYBxWX1
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 4/200 2026-08-15 04:17 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
信息提示
请填处理意见