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lxj2007

铁虫 (正式写手)

[求助] 利用MS7.0 来做分子动力学模拟,可compass等力场中没有我研究的气体SO2F2怎么办? 已有1人参与

本人新手,在用material sdutio7.0 来做分子动力学模拟时,遇到现有的compass等相关力场中没有我研究的气体SO2F2的相关参数怎么办?
用discover-smartminimer最小化后,利用AmorphousCell建立无定型晶包时构建失败如图所示,请高手指点一二,谢谢!

利用MS7.0 来做分子动力学模拟,可compass等力场中没有我研究的气体SO2F2怎么办?
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利用MS7.0 来做分子动力学模拟,可compass等力场中没有我研究的气体SO2F2怎么办?-1
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lxj2007: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 很专业,对我这菜鸟很细心,指教到位,虽然我还没有完全解决这问题。 2017-03-02 10:04:53
引用回帖:
6楼: Originally posted by lxj2007 at 2017-02-28 18:15:39
老师您好!我检查了一下我的分子之前是画错了,S是六个键的,S=O是双键,S-F是单键,我改过来运行minimer是成功的,但用AC构建就failed(见图片),谢谢老师,麻烦您帮我看看究竟是什么缘故。

minimer successful ...

用AC-->Calculation,其中力场配置跟Discover中所用一致,即可成功构建。
利用MS7.0 来做分子动力学模拟,可compass等力场中没有我研究的气体SO2F2怎么办?-2
附图.png

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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
7楼2017-03-01 09:08:41
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

如果没有力场参数,smart minimer怎么运行成功的?
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
2楼2017-02-28 14:12:35
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月只蓝: 屏蔽内容, 学术性版块,禁止灌水,警告一次! 2017-02-28 14:35:17
本帖内容被屏蔽

3楼2017-02-28 14:26:38
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lxj2007

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-02-28 14:12:35
如果没有力场参数,smart minimer怎么运行成功的?

您好!这个具体我也不时很懂,但是在优化结构基础上进行AC建无定型晶包就出现错误:AmorphousCellConstruct failed because the constituent molecules contain atom。不知道您能帮我解决这个问题吗?谢谢!
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4楼2017-02-28 14:49:26
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