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mhb828

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] HPLC测甲基化水平实验

我在看文献是发现HPLC测DNA甲基化水平实验中。标准样品有多种选择:

A:C  和5-mC

B:   dC 和 5-mdC

C:   dCMP  和 5mdCMP

这样三组,我该选哪一组?
文献中B组选用最多,但 5-mdC我没有在sigma网站上找到编码货号,谁能告知一下?A组sigma上都有用A组行不行,C组中的5mdCMP  sigma上也没有找到。
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★
mhb828(金币+5,VIP+0):thanks 4-16 23:32
mhb828(金币+1,VIP+0):3ks 4-25 01:36
C才是最准确的
截取一段我整理的资料……

【原理】
将DNA酶解为单核苷酸,过HPLC柱,将dAMP、dTMP、dGMP、dCMP以及mdCMP(甲基化状态的C)分离,分别测得mdCMP、dCMP在280nm出的吸收峰的积分面积,即可计算甲基化的C的百分含量。
    这是检测全基因组甲基化水平的标准方法。
3楼2009-04-15 20:32:34
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浪漫小床

至尊木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
mhb828(金币+5,VIP+0):thanks 4-16 23:33
mhb828(金币+1,VIP+0):3ks 4-25 01:35
我的课题与甲基化相关,也要用到色谱法。我个人倾向于A
小木虫冀东地区总书记
2楼2009-04-15 18:53:39
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mhb828

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2009-4-15 20:32:
C才是最准确的
截取一段我整理的资料……

【原理】
将DNA酶解为单核苷酸,过HPLC柱,将dAMP、dTMP、dGMP、dCMP以及mdCMP(甲基化状态的C)分离,分别测得mdCMP、dCMP在280nm出的吸收峰的积分面积,即可计算甲 ...

请问C 在哪儿可以买到? 可否有文献参考?
4楼2009-04-18 22:15:45
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★
mhb828(金币+3,VIP+0):3ks 4-20 09:08
mhb828(金币+1,VIP+0):3ks 4-25 01:36
这个……我记得就是sigma的……
要不问问销售?让他帮你查
5楼2009-04-18 22:48:50
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