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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » HPLC测甲基化水平实验
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mhb828

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] HPLC测甲基化水平实验

我在看文献是发现HPLC测DNA甲基化水平实验中。标准样品有多种选择：

A：C  和5-mC

B:   dC 和 5-mdC

C:   dCMP  和 5mdCMP

这样三组，我该选哪一组？
文献中B组选用最多，但 5-mdC我没有在sigma网站上找到编码货号，谁能告知一下？A组sigma上都有用A组行不行，C组中的5mdCMP  sigma上也没有找到。
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1楼 2008-12-20 22:01:37
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浪漫小床

至尊木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
mhb828(金币+5,VIP+0):thanks 4-16 23:33
mhb828(金币+1,VIP+0):3ks 4-25 01:35
我的课题与甲基化相关，也要用到色谱法。我个人倾向于A
赞一下(4人) 回复此楼
小木虫冀东地区总书记
2楼2009-04-15 18:53:39
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★
mhb828(金币+5,VIP+0):thanks 4-16 23:32
mhb828(金币+1,VIP+0):3ks 4-25 01:36
C才是最准确的
截取一段我整理的资料……

【原理】
将DNA酶解为单核苷酸，过HPLC柱，将dAMP、dTMP、dGMP、dCMP以及mdCMP（甲基化状态的C）分离，分别测得mdCMP、dCMP在280nm出的吸收峰的积分面积，即可计算甲基化的C的百分含量。
    这是检测全基因组甲基化水平的标准方法。
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3楼2009-04-15 20:32:34
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mhb828

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2009-4-15 20:32:
C才是最准确的
截取一段我整理的资料……

【原理】
将DNA酶解为单核苷酸，过HPLC柱，将dAMP、dTMP、dGMP、dCMP以及mdCMP（甲基化状态的C）分离，分别测得mdCMP、dCMP在280nm出的吸收峰的积分面积，即可计算甲 ...

请问C 在哪儿可以买到？ 可否有文献参考？
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4楼2009-04-18 22:15:45
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★
mhb828(金币+3,VIP+0):3ks 4-20 09:08
mhb828(金币+1,VIP+0):3ks 4-25 01:36
这个……我记得就是sigma的……
要不问问销售？让他帮你查
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5楼2009-04-18 22:48:50
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