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有关cuffdiff的提问
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大家好，我现在有一个问题，在做cuffdiff之前一般都会先做cufflinks和cuffmerge来生成样品的转录本注释文件，这个注释文件会在cuffdiff中被使用到，那么我可否不使用这个注释文件，直接用之前tophat使用的全基因组注释文件来运行cuffdiff呢，还有就是cuffdiff在运行时会对reads进行组装拼接吗 如题！上网上查说的都不一样啊！这两者应该怎么换算啊 [ Last edited by 一条求知的虫 on 2017-9-4 at 11:25 ] |
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