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jinzheln

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】怎样使用PDB数据库

怎样使用PDB数据库通过化合物结构，来寻找与之相匹配的蛋白质？化合物结构能输入进去么？怎样输入化合物结构？

[ Last edited by zdhlover on 2009-12-13 at 23:03 ]
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1楼 2008-12-19 00:32:22
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★
mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢您的帮助
PDB只是一个筐，大家把测得的蛋白质晶体结构扔进去，完事。

建议你看看徐筱杰、蒋华良等人的书。
另外，网上找找“一步一步学习计算机辅助药物设计”这篇咚咚。
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2楼2008-12-19 09:11:47
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香薷谷

金虫 (小有名气)
★
mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢您的帮助
用pdb的advanced search 里面的ligand structure/ ligand ID /ligand name ，根据你的需要。
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3楼2008-12-19 09:15:23
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★
xuefei06(金币+1,VIP+0):感谢你的参与，欢迎你继续关注计算综合版！
呵呵，欧洲的MSDsite比这个要详细得多
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4楼2008-12-19 10:46:24
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loappleve

金虫 (小有名气)
★
xuefei06(金币+1,VIP+0):感谢你的参与，欢迎你继续关注计算综合版！
这种逆向检索需要别的对pdb数据库进行加工标引过的数据库来进行
我用过TIP
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5楼2008-12-19 17:14:39
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