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allenjobsf853

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】全原子模型和united atom模型的区别?

在论文上看见在进行模拟计算的时候,有些论文说采用全原子模型,而不采用united atom,请教一下,如何在模拟中体现出来使用的是哪种模型?

和同学讨论了一下,有人认为这个是根据使用的力场的不同来区分的,比如compass力场就是全原子模型,而有些力场就不是全原子模型


而我个人为是根据vdw和electrostatic的summation方法选择atom base和group base的不同造成的,如果将基团看做group base,应该就属于united atom了吧?

还是很迷惑,希望高人传道授业解惑下。  


先谢谢了

[ Last edited by zdhlover on 2009-12-10 at 15:32 ]
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allenjobsf853

铜虫 (小有名气)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
恩  我也是这么听人说的  但是也有同仁和我说如果你建立模型的时候如果讲某些基团,比如CH3作为一个整体进行计算的话,用一些全原子模型的力场,比如COMPASS力场也算是united-atom模型吧   

闹不清,比较困惑
4楼2008-12-19 15:04:55
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

俺一点也不懂啊,等你指教呢
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
2楼2008-12-18 14:42:57
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jqhejia

银虫 (正式写手)

★
yyx19840628(金币+1,VIP+0):xiexie
个人认为是根据使用的力场的不同来区分的,有的力场就是全原子模型,而有些力场如NERO就不是全原子模型。
3楼2008-12-18 19:56:03
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wpllzx

铜虫 (正式写手)

是啊,一直不被“全原子模型”和“联合原子模型”这两个概念迷惑?
5楼2008-12-24 16:02:16
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