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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】 dipole-ACF(偶极子自相关函数)的物理意义
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tttl060

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】 dipole-ACF(偶极子自相关函数)的物理意义

如题

dipole-ACF的物理意思能理解成转动吗? 比如水分子的偶极自相关函数随时间的变化率是分子的转动位移吗?  请大伙支招!

[ Last edited by zdhlover on 2009-12-13 at 23:04 ]
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1楼 2008-12-16 15:27:02
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tttl060

金虫 (著名写手)
( U(t) * U(0) )
C = ---------------------
      ( U(0) * U(0) )
这个式子是归一化的.如果去了分母的归一化因子会影响到结果吗?即:C =   ( U(t) * U(0) )  这条曲线代表分子转动位移吗  ?
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3楼2008-12-17 08:26:01
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wgpig

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
gwdavid(金币+3,VIP+0):谢谢！
引用回帖:
Originally posted by tttl060 at 2008-12-16 15:27:
如题

dipole-ACF的物理意思能理解成转动吗? 比如水分子的偶极自相关函数随时间的变化率是分子的转动位移吗?  请大伙支招!

U(t)=Sigma( u(t) )

      ( U(t) * U(0) )
C = ---------------------
      ( U(0) * U(0) )

这个两个？
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2楼2008-12-16 15:48:43
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wgpig

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢
现在手头上没有资料，只能凭记忆写一点，不保证公式都正确（这个回去后再做修正）。

首先前面给的公式就错了，看到你的回复我才想起来。sorry。公式应该是：
U(t)=Sigma( u(t) )

      < U(t) * U(0) >
C = ---------------------
      < U(0) * U(0) >

才对。

那么这个是从velocity autocorrelation function演化而来的
C=Sigma( Sigma( v(t) *vt(t+ tj)) )

去掉分母，估计不影响整体的趋势，但肯定影响结果。

我认为这个包括了平动和转动的。
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4楼2008-12-17 09:26:52
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tttl060

金虫 (著名写手)
当初我第一次看到你写的公式的时候,我就理解成纠正后的样子...去掉分母,两者结果肯定不会一样,但是反映问题的本质都是转动,公式中u(t)代表的是偶极向量,对与水分子来说,可以理解成转动?  平动由Mean-Square Displacements来表征...期待给出进一步的信息!感谢wgpig的帮助.......
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5楼2008-12-17 16:04:38
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