应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台» 网络生活区» 有奖问答 » 有奖问答中转子版 » 求助生物信息学作业【有效期至2008年12月17日】
汕头大学海洋科学接受调剂
51/1返回列表
查看: 176  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

eagle08

木虫 (著名写手)

[交流] 求助生物信息学作业【有效期至2008年12月17日】

以下是作业题目，还望各位虫友多费心【急盼中】
下面这条序列可能编码什么蛋白？用生物信息学方法分析蛋白的功能及理化特性（要求简要写出分析过程，内容要包括蛋白序列，蛋白主要功能，
          序列中含有DOMAIN的名字以及DOMAIN在PFAM数据库中的ID号，分子量，预测一下二级结构等）。

                   CGAGATCCCGGGGAGCCAGCTTGCTGGGAGAGCGGGACGGTCCGGAGCAAGCCCAGAGGCAGAGGAGGCGACAGAG

    GGAAAAAGGGCCGAGCTAGCCGCTCCAGTGCTGTACAGGAGCCGAAGGGACGCACCACGCCAGCCCCAGCCCGGCT
    CCAGCGACAGCCAACGCCTCTTGCAGCGCGGCGGCTTCGAAGCCGCCGCCCGGAGCTGCCCTTTCCTCTTCGGTGA
    AGTTTTTAAAAGCTGCTAAAGACTCGGAGGAAGCAAGGAAAGTGCCTGGTAGGACTGACGGCTGCCTTTGTCCTCC
    TCCTCTCCACCCCGCCTCCCCCCACCCTGCCTTCCCCCCCTCCCCCGTCTTCTCTCCCGCAGCTGCCTCAGTCGGC
    TACTCTCAGCCAACCCCCCTCACCACCCTTCTCCCCACCCGCCCCCCCGCCCCCGTCGGCCCAGCGCTGCCAGCCC
    GAGTTTGCAGAGAGGTAACTCCCTTTGGCTGCGAGCGGGCGAGCTAGCTGCACATTGCAAAGAAGGCTCTTAGGAG
    CCAGGCGACTGGGGAGCGGCTTCAGCACTGCAGCCACGACCCGCCTGGTTAGGCTGCACGCGGAGAGAACCCTCTG
    TTTTCCCCCACTCTCTCTCCACCTCCTCCTGCCTTCCCCACCCCGAGTGCGGAGCCAGAGATCAAAAGATGAAAAG
    GCAGTCAGGTCTTCAGTAGCCAAAAAACAAAACAAACAAAAACAAAAAAGCCGAAATAAAAGAAAAAGATAATAAC
    TCAGTTCTTATTTGCACCTACTTCAGTGGACACTGAATTTGGAAGGTGGAGGATTTTGTTTTTTTCTTTTAAGATC
    TGGGCATCTTTTGAATCTACCCTTCAAGTATTAAGAGACAGACTGTGAGCCTAGCAGGGCAGATCTTGTCCACCGT
    GTGTCTTCTTCTGCACGAGACTTTGAGGCTGTCAGAGCGCTTTTTGCGTGGTTGCTCCCGCAAGTTTCCTTCTCTG
    GAGCTTCCCGCAGGTGGGCAGCTAGCTGCAGCGACTACCGCATCATCACAGCCTGTTGAACTCTTCTGAGCAAGAG
    AAGGGGAGGCGGGGTAAGGGAAGTAGGTGGAAGATTCAGCCAAGCTCAAGGATGGAAGTGCAGTTAGGGCTGGGAA
    GGGTCTACCCTCGGCCGCCGTCCAAGACCTACCGAGGAGCTTTCCAGAATCTGTTCCAGAGCGTGCGCGAAGTGAT
    CCAGAACCCGGGCCCCAGGCACCCAGAGGCCGCGAGCGCAGCACCTCCCGGCGCCAGTTTGCTGCTGCTGCAGCAG
    CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAAGAGACTAGCCCCA
    GGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGGTGAGGATGGTTCTCCCCAAGCCCATCGTAGAGGCCCCACAGGCTACCTGGTCCT
    GGATGAGGAACAGCAACCTTCACAGCCGCAGTCGGCCCTGGAGTGCCACCCCGAGAGAGGTTGCGTCCCAGAGCCT
    GGAGCCGCCGTGGCCGCCAGCAAGGGGCTGCCGCAGCAGCTGCCAGCACCTCCGGACGAGGATGACTCAGCTGCCC
    CATCCACGTTGTCCCTGCTGGGCCCCACTTTCCCCGGCTTAAGCAGCTGCTCCGCTGACCTTAAAGACATCCTGAG
    CGAGGCCAGCACCATGCAACTCCTTCAGCAACAGCAGCAGGAAGCAGTATCCGAAGGCAGCAGCAGCGGGAGAGCG
    AGGGAGGCCTCGGGGGCTCCCACTTCCTCCAAGGACAATTACTTAGGGGGCACTTCGACCATTTCTGACAACGCCA
    AGGAGTTGTGTAAGGCAGTGTCGGTGTCCATGGGCCTGGGTGTGGAGGCGTTGGAGCATCTGAGTCCAGGGGAACA
    GCTTCGGGGGGATTGCATGTACGCCCCACTTTTGGGAGTTCCACCCGCTGTGCGTCCCACTCCTTGTGCCCCATTG
    GCCGAATGCAAAGGTTCTCTGCTAGACGACAGCGCAGGCAAGAGCACTGAAGATACTGCTGAGTATTCCCCTTTCA
    AGGGAGGTTACACCAAAGGGCTAGAAGGCGAGAGCCTAGGCTGCTCTGGCAGCGCTGCAGCAGGGAGCTCCGGGAC
    ACTTGAACTGCCGTCTACCCTGTCTCTCTACAAGTCCGGAGCACTGGACGAGGCAGCTGCGTACCAGAGTCGCGAC
    TACTACAACTTTCCACTGGCTCTGGCCGGACCGCCGCCCCCTCCGCCGCCTCCCCATCCCCACGCTCGCATCAAGC
    TGGAGAACCCGCTGGACTACGGCAGCGCCTGGGCGGCTGCGGCGGCGCAGTGCCGCTATGGGGACCTGGCGAGCCT
    GCATGGCGCGGGTGCAGCGGGACCCGGTTCTGGGTCACCCTCAGCCGCCGCTTCCTCATCCTGGCACACTCTCTTC
    ACAGCCGAAGAAGGCCAGTTGTATGGACCGTGTGGTGGTGGTGGGGGTGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCG
    GCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGAGGCGGGAGCTGTAGCCCCCTACGGCTACACTCGGCCCCCTCAGGGGCT
    GGCGGGCCAGGAAAGCGACTTCACCGCACCTGATGTGTGGTACCCTGGCGGCATGGTGAGCAGAGTGCCCTATCCC
    AGTCCCACTTGTGTCAAAAGCGAAATGGGCCCCTGGATGGATAGCTACTCCGGACCTTACGGGGACATGCGTTTGG
    AGACTGCCAGGGACCATGTTTTGCCCATTGACTATTACTTTCCACCCCAGAAGACCTGCCTGATCTGTGGAGATGA
    AGCTTCTGGGTGTCACTATGGAGCTCTCACATGTGGAAGCTGCAAGGTCTTCTTCAAAAGAGCCGCTGAAGGGAAA
    CAGAAGTACCTGTGCGCCAGCAGAAATGATTGCACTATTGATAAATTCCGAAGGAAAAATTGTCCATCTTGTCGTC
    TTCGGAAATGTTATGAAGCAGGGATGACTCTGGGAGCCCGGAAGCTGAAGAAACTTGGTAATCTGAAACTACAGGA
    GGAAGGAGAGGCTTCCAGCACCACCAGCCCCACTGAGGAGACAACCCAGAAGCTGACAGTGTCACACATTGAAGGC
    TATGAATGTCAGCCCATCTTTCTGAATGTCCTGGAAGCCATTGAGCCAGGTGTAGTGTGTGCTGGACACGACAACA
    ACCAGCCCGACTCCTTTGCAGCCTTGCTCTCTAGCCTCAATGAACTGGGAGAGAGACAGCTTGTACACGTGGTCAA
    GTGGGCCAAGGCCTTGCCTGGCTTCCGCAACTTACACGTGGACGACCAGATGGCTGTCATTCAGTACTCCTGGATG
    GGGCTCATGGTGTTTGCCATGGGCTGGCGATCCTTCACCAATGTCAACTCCAGGATGCTCTACTTCGCCCCTGATC
    TGGTTTTCAATGAGTACCGCATGCACAAGTCCCGGATGTACAGCCAGTGTGTCCGAATGAGGCACCTCTCTCAAGA
    GTTTGGATGGCTCCAAATCACCCCCCAGGAATTCCTGTGCATGAAAGCACTGCTACTCTTCAGCATTATTCCAGTG
    GATGGGCTGAAAAATCAAAAATTCTTTGATGAACTTCGAATGAACTACATCAAGGAACTCGATCGTATCATTGCAT
    GCAAAAGAAAAAATCCCACATCCTGCTCAAGACGCTTCTACCAGCTCACCAAGCTCCTGGACTCCGTGCAGCCTAT
    TGCGAGAGAGCTGCATCAGTTCACTTTTGACCTGCTAATCAAGTCACACATGGTGAGCGTGGACTTTCCGGAAATG
    ATGGCAGAGATCATCTCTGTGCAAGTGCCCAAGATCCTTTCTGGGAAAGTCAAGCCCATCTATTTCCACACCCAGT
    GAAGCATTGGAAACCCTATTTCCCCACCCCAGCTCATGCCCCCTTTCAGATGTCTTCTGCCTGTTATAACTCTGCA
    CTACTCCTCTGCAGTGCCTTGGGGAATTTCCTCTATTGATGTACAGTCTGTCATGAACATGTTCCTGAATTCTATT
    TGCTGGGCTTTTTTTTTCTCTTTCTCTCCTTTCTTTTTCTTCTTCCCTCCCTATCTAACCCTCCCATGGCACCTTC
    AGACTTTGCTTCCCATTGTGGCTCCTATCTGTGTTTTGAATGGTGTTGTATGCCTTTAAATCTGTGATGATCCTCA
    TATGGCCCAGTGTCAAGTTGTGCTTGTTTACAGCACTACTCTGTGCCAGCCACACAAACGTTTACTTATCTTATGC
    CACGGGAAGTTTAGAGAGCTAAGATTATCTGGGGAAATCAAAACAAAAACAAGCAAAC
回复此楼

» 猜你喜欢
己所不欲勿施于人
1楼 2008-12-16 08:16:04
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qaz309

金虫 (小有名气)
★ ★
eagle08(金币+2,VIP+0):虽然看不太懂，但依然感谢
http://pfam.sanger.ac.uk/search/ ... D-8D35-881D8C396E36

答案在这个网址上，楼主自己看吧
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2008-12-16 11:46:19
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

qaz309

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
eagle08(金币+5,VIP+0):太感谢了，再详细点就更好了
蛋白： androgen receptor [Homo sapiens]  人类男性激素受体

分析过程：这是一段含有内含子的基因序列，先用blastn搜索，可获得蛋白序列，再用获得的蛋白序列，blastp和在pFAM上分析，可获得蛋白名称，结构域
用Jpred数据库预测二级结构
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2008-12-16 11:18:35
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

eagle08

木虫 (著名写手)
楼上是内行呀，多谢了
赞一下 回复此楼
己所不欲勿施于人
3楼2008-12-16 11:23:16
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 305求调剂 +8 玛卡巴卡boom 2026-04-11 8/400 2026-04-14 09:04 by pengliang8036
[考研] 288求调剂，一志愿华南理工大学071005 +24 ioodiiij 2026-04-08 24/1200 2026-04-14 08:42 by nana_zhong
[考研] 310求调剂 +15 666真好 2026-04-11 17/850 2026-04-13 22:27 by pies112
[考研] 0856专硕求调剂 希望是a区院校 +24 好好休息好不好 2026-04-09 27/1350 2026-04-13 22:22 by pies112
[考研] 本科郑州大学，一志愿华东师范大学282求调剂 +28 熊哥xtk 2026-04-07 33/1650 2026-04-13 17:48 by 邹gv
[考研] 290求调剂 +18 柯淮然 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 12:56 by cyh—315
[考研] 266调剂 +10 daya sun 2026-04-07 11/550 2026-04-13 10:12 by fenglj492
[考研] 22408 352分求调剂 +5 努力的夏末 2026-04-09 5/250 2026-04-12 19:17 by wj165256
[考研] 一志愿华中农微生物，288分，三年实验经历 +11 代fish 2026-04-09 11/550 2026-04-12 10:21 by Hayaay
[考研] 0860004 求调剂 309分 +9 Yin DY 2026-04-08 9/450 2026-04-11 22:55 by dongdian1
[教师之家] 请问地理、遥感方面，可以做哪些横向项目啊，纵向完不成考核啊 +3 锦衣卫寒战 2026-04-07 5/250 2026-04-11 20:51 by 豫椒
[考研] 求调剂 +11 翩翩一书生 2026-04-09 11/550 2026-04-11 19:57 by 逆水乘风
[考研] 085410 273分调剂 +4 X1999 2026-04-09 4/200 2026-04-11 13:05 by pies112
[考研] 农学0904 312求调剂 +6 Say Never 2026-04-10 6/300 2026-04-11 10:33 by wwj2530616
[考研] 266求调剂 +29 阳阳哇塞 2026-04-07 29/1450 2026-04-10 16:20 by 高维春
[考研] 机械专368 有去处吗 +4 种大树 2026-04-10 4/200 2026-04-10 15:31 by jiajinhpu
[考研] 一志愿华东师范生物学326分，求调剂 +8 刘墨墨 2026-04-09 8/400 2026-04-10 12:00 by pengliang8036
[考研] 机械专硕273请求调剂 +6 庚申壬申 2026-04-07 6/300 2026-04-08 22:41 by bljnqdcc
[考研] 287求调剂 +6 Fnhc 2026-04-07 6/300 2026-04-08 10:05 by xingguangj
[考研] 263分B区求调剂 +6 李nihao 2026-04-08 6/300 2026-04-08 09:38 by 南开小綦
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭