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gromacs DPPC实例中不会建confout.gro文件 已有1人参与
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我在“Pack the lipids around the protein”那步，能量最小化的时候看不懂。 Note how many lipids were deleted and update the [ molecules ] directive of your topology accordingly. Run energy minimization. Then, scale down the lipids by a factor of 0.95 (assuming you have used default names, the result of the minimization is called "confout.gro" perl inflategro.pl confout.gro 0.95 DPPC 0 system_shrink1.gro 5 area_shrink1.dat 我不知道上面说的记录脂质分子减少怎么记录，又要在哪个文件下更新这些数据？ 还有要怎么样能量最小化，才能产生confout.gro文件。 |
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