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新虫 (初入文坛)

[求助] 求助！gromcs创建盒子，盒子里加入2个小肽（原始文件为PDB格式）。已有1人参与

怎么才能在一个盒子里加入2个小肽（要求者两个小肽不重叠）？盒子设定为正方体，小肽的原始文件为PDB格式，现在用的软件是gromacs4.5.1。大神呢，拯救我这个小白吧！

1楼 2017-01-16 14:43:42

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铁虫 (初入文坛)

感谢参与，应助指数 +1

使用packmol软件建模，准备好in文件就可以，不是很难，这是packmol的一些资料，你可以参考一下
http://blog.sciencenet.cn/blog-548663-994817.html

希望能做好科研

2楼2017-01-18 10:14:34

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3楼2017-01-18 10:32:30

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