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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » NAMD求助
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fanhuifang

新虫 (初入文坛)

[求助] NAMD求助 已有1人参与

请问NAMD出现这个错误的原因是什么？
FATAL ERROR: Low global exclusion count!  (171571 vs 171580)  System unstable or pairlistdist or cutoff too small.里面的数字代表什么？
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1楼 2017-01-15 14:24:36
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lestatx

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
fanhuifang: 金币+5, ★有帮助 2017-03-20 08:38:32
系统不稳定，可能有原子位置冲突或者键长/键角有问题
你的体系、步骤是什么？开始模拟之前运行minimize了吗？
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2楼2017-01-23 11:00:34
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一时花开11

新虫 (正式写手)
楼主您好，我现在也出现这个问题，但是不知道如何解决，在进行MD之前我已经进行过minimize了的，可否分享一下解决方案

发自小木虫Android客户端
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3楼2018-04-24 10:58:54
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