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baiduyun

铁虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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在线: 9.9小时
虫号: 3964525
注册: 2015-07-10
性别: GG
专业: 作物分子育种

[求助] 如何在一个大群体下（比如500的样本）检测一个基因的突变位点已有1人参与

目前已经知道一个基因，他有多个SNP的突变，想在一个500个样本的群体中把突变的SNP信息找全，可以怎样做。
之前自己都是扩增出来，送公司测序，但是觉得太耗时耗力了。
想请教一下有没有什么技术手段可以实现。

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偷得浮生半日闲

1楼 2017-01-12 16:31:33

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

rhapsody007

金虫 (小有名气)

MolEPI: 1
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注册: 2013-05-15
性别: GG
专业: 基因组学

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

可以考虑用酶切扩增多态性（cleaved amplified polymorphicsequences，CAPS）验证SNP位点，但同样耗费精力，成本是降低了，但实验量增加了。
扩增后送测序，比对测序结果，得到SNP位点，这条路是工作量最小的，但是花钱多
还有个验证SNP的方法是温度开关PCR（TSP，Temperature-switch PCR,）但是好像局限性很大，对引物要求特别高，条件不好控制

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吉恩特磁珠

2楼2017-01-13 10:41:41