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baiduyun

铁虫 (初入文坛)

[求助] 如何在一个大群体下(比如500的样本)检测一个基因的突变位点 已有1人参与

目前已经知道一个基因,他有多个SNP的突变,想在一个500个样本的群体中把突变的SNP信息找全,可以怎样做。
之前自己都是扩增出来,送公司测序,但是觉得太耗时耗力了。
想请教一下有没有什么技术手段  可以实现。
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偷得浮生半日闲
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rhapsody007

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以考虑用 酶切扩增多态性(cleaved amplified polymorphicsequences,CAPS)验证SNP位点,但同样耗费精力,成本是降低了,但实验量增加了。
扩增后送测序,比对测序结果,得到SNP位点,这条路是工作量最小的,但是花钱多
还有个验证SNP的方法是温度开关PCR(TSP,Temperature-switch PCR,)但是好像局限性很大,对引物要求特别高,条件不好控制
吉恩特磁珠
2楼2017-01-13 10:41:41
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