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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » NAMD并行计算求助
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martinique

金虫 (初入文坛)

[求助] NAMD并行计算求助 已有2人参与

请教各位大神，我的工作站是28核56线程，但提交NAMD任务后，每个线程都无法全速计算，CPU只用了4%，如何解决呢？系统是win7。谢谢！

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1楼 2017-01-11 19:53:14
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amaxzhou

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
NAMD为什么不用GPU并行计算加速呢？
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2楼2017-01-13 09:12:40
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martinique

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by amaxzhou at 2017-01-13 09:12:40
NAMD为什么不用GPU并行计算加速呢？

因为没有GPU。。。

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3楼2017-01-13 09:48:53
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amaxzhou

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by martinique at 2017-01-13 09:48:53
因为没有GPU。。。
...

^_^GPU对NAMD提速很明显，有没有考虑升级GPU服务器？

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4楼2017-01-13 15:22:06
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fangshaq

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

namd2.exe ＋p28(#28是想用的核数，可以改动） xxx.conf
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5楼2018-04-11 09:40:52
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