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yqxuefei

铜虫 (初入文坛)


[交流] 求助 求NiSi的晶体结构

我最近想用vasp计算NiSi  但又不知道它的晶体结构   因此没办法填写POSCAR  请问哪位高手可以帮忙?我想下个icsd  又找不到下载地址  清华的那个ftp死活登不上去
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yqxuefei

铜虫 (初入文坛)


我自己在icsd上查到相关信息。可是有些看不懂。
首先谢谢楼上的回复。这是ICSD上面的信息吧?应该是正交结构。我看不懂的是这几行。
ed Cell  P 3.332 5.175 5.609 89.999 89.999 90 96.73
Trans Red  0.000 1.000 0.000 / 1.000 0.000 0.000 / 0.000 0.000 -1.000
1.a=5.175 b=3.332 c=5.609 这样理解对吗?
2.0.000 1.000 0.000 / 1.000 0.000 0.000 / 0.000 0.000 -1.000 这是a,b,c的坐标吧?是不是顺序不对了?第3个坐标为什么是-1.000呢?好像没见过啊。
3.Atom #  OX  SITE   x      y      z      SOF   H
Ni  1 +0  4 c  0.00785(2) 0.250    0.18731(2)   1.     0  
Si  1 +0  4 c  0.32152(6) 0.750    0.08166(6)   1.     0
这个的意思是Ni在上面的坐标下处于0.00785(2) 0.250    0.18731(2)的位置吧?而Si处于0.32152(6) 0.750    0.08166(6)的位置?
4.如果我想写一个NiSi的晶胞根据上面的信息该怎么写呢?谢谢!
2楼2008-12-17 15:45:25
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weiqi361

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
waiy2001(金币+5,VIP+0):谢谢,辛苦了
*data for   ICSD #95448
Coll Code   95448
Rec  Date   2003/10/01
Mod  Date   2006/04/01
Chem Name   Nickel Silicide (1/1)
Structured  Ni Si
Sum         Ni1 Si1
ANX         NO
D(calc)     5.96
Title       Atomic structure and enormous anisotropy of thermal expansion in Ni
            Si single crystals. I. Refinement of structure models
Author(s)   Rabadanov, M.Kh.;Ataev, M.B.
Reference   Kristallografiya
            (2002), 47(1), 40-45
            Izvestiya Akademii Nauk SSSR, Neorganicheskie Materialy
            (2002), 38(2), 166-170
Unit Cell   5.1752(7) 3.3321(5) 5.6094(9) 90 90 90
Vol         96.73
Z           4
Space Group P n m a
SG Number   62
Cryst Sys   orthorhombic
Pearson     oP8
Wyckoff     c2
R Value     .0088
Red Cell    P  3.332 5.175 5.609 89.999 89.999 90 96.73
Trans Red   0.000 1.000 0.000 / 1.000 0.000 0.000 / 0.000 0.000 -1.000
Comments    Anharmonic temperature factors given
            The structure has been assigned a PDF number (calculated
            powder diffraction data): 01-070-9169
            The structure has been assigned a PDF number (experimental
            powder diffraction data): 65-1475
            Temperature in Kelvin: 295
            Structure type : MnP
            X-ray diffraction from single crystal
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H
Ni   1  +0    4 c   0.00785(2)  0.250       0.18731(2)     1.         0   
Si   1  +0    4 c   0.32152(6)  0.750       0.08166(6)     1.         0   
Lbl  Type   Beta11      Beta22      Beta33      Beta12      Beta13      Beta23
Ni1  Ni0+  0.00237(4)  0.00667(4)  0.00436(4)  0.          -.00002(1)  0.         
Si1  Si0+  0.00304(8)  0.00583(7)  0.00585(8)  0.          -.00022(3)  0.         
*end for    ICSD #95448
3楼2008-12-17 16:11:04
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weiqi361

铜虫 (小有名气)

空间群Pnma
晶胞参数 5.1752(7) 3.3321(5) 5.6094(9) 90 90 90
Z =    4
原子坐标如下:

Ni   0.00785(2)  0.250       0.18731(2)        
Si   0.32152(6)  0.750       0.08166(6)
4楼2008-12-17 16:13:29
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weiqi361

铜虫 (小有名气)

下面是CIF格式


data_95448-ICSD
#?2008 by Fachinformationszentrum Karlsruhe, and the U.S. Secretary of
#Commerce on behalf of the United States.  All rights reserved.
_database_code_ICSD                95448
_audit_creation_date               2003/10/01
_audit_update_record               2006/04/01
_chemical_name_systematic          'Nickel Silicide (1/1)'
_chemical_formula_structural       'Ni Si'
_chemical_formula_sum              'Ni1 Si1'
_publ_section_title
;
Atomic structure and enormous anisotropy of thermal expansion in Ni
Si single crystals. I. Refinement of structure models
;
loop_
_citation_id
_citation_journal_abbrev
_citation_year
_citation_journal_volume
_citation_journal_issue
_citation_page_first
_citation_page_last
_citation_journal_id_ASTM
primary Kristallografiya 2002 47 1 40 45 KRISAJ
2 'Izvestiya Akademii Nauk SSSR, Neorganicheskie Materialy'
2002 38 2 166 170 IVNMAW
_publ_author_name                  'Rabadanov, M.Kh.;Ataev, M.B.'
_cell_length_a                     5.1752(7)
_cell_length_b                     3.3321(5)
_cell_length_c                     5.6094(9)
_cell_angle_alpha                  90
_cell_angle_beta                   90
_cell_angle_gamma                  90
_cell_volume                       96.73
_cell_formula_units_Z              4
_symmetry_space_group_name_H-M     'P n m a'
_symmetry_Int_Tables_number        62
_refine_ls_R_factor_all            .0088
loop_
_symmetry_equiv_pos_site_id
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
  1        'x+.5, y, -z+.5'
  2        'x, -y+.5, z'
  3        '-x+.5, y+.5, z+.5'
  4        '-x, -y, -z'
  5        '-x+.5, -y, z+.5'
  6        '-x, y+.5, -z'
  7        'x+.5, -y+.5, -z+.5'
  8        'x, y, z'
loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_oxidation_number
Ni0+        0
Si0+        0
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_symmetry_multiplicity
_atom_site_Wyckoff_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_occupancy
_atom_site_attached_hydrogens
Ni1 Ni0+ 4 c 0.00785(2) 0.250 0.18731(2) 1. 0
Si1 Si0+ 4 c 0.32152(6) 0.750 0.08166(6) 1. 0

#End of data_95448-ICSD
5楼2008-12-17 16:14:34
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weiqi361

铜虫 (小有名气)

INS格式如下:

TITL icsd
CELL   0.0000   5.1752   3.3321   5.6094  90.0000  90.0000  90.0000
LATT 1
SYMM -X+1/2,-Y,Z+1/2
SYMM -X,Y+1/2,-Z
SYMM X+1/2,-Y+1/2,-Z+1/2
SFAC Ni Si
NI1   1    0.00785    0.25000    0.18731    0.50000   0.00000
SI1   2    0.32152    0.75000    0.08166    0.50000   0.00000
END
6楼2008-12-17 16:19:34
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yqxuefei

铜虫 (初入文坛)


兄弟谢过了
7楼2008-12-18 11:06:54
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yqxuefei

铜虫 (初入文坛)


只是不知道怎样导入到MS中呢?
8楼2008-12-18 22:58:18
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


waiy2001(金币+1,VIP+0):谢谢提醒
这些都是text文件.
比如cif,
你存成.cif 就可以了.
xi2004-emuch@163.com
9楼2008-12-18 23:37:01
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yqxuefei

铜虫 (初入文坛)


又有问题了
把cif格式的文件打开后,图片只能旋转,不能左右移动,想选中一个原子点击却没反应。想castep   run和files却提示权限不够。请问是怎么回事呢?
谢谢!
10楼2008-12-19 10:17:04
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