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新虫 (初入文坛)

[求助] 关于gromacs教程的疑惑问题

我做了官网的例子。第一个和第五个,首先我做的这两个为啥生成的分子都不是带整数的电荷,第二点就是第五个配体蛋白的那个为啥我在一开始加离子前生成tpr文件的时候,告诉我topol里的坐标文件比gro里面的多了15个。我都是按照教程里来的,不知道哪位大神能给一个解释啊

关于gromacs教程的疑惑问题


关于gromacs教程的疑惑问题-1


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2货就是

新虫 (初入文坛)

the first one is flowting point arithmetic problem. it's ok to have charges like 6.00001. for the second one, please check your coordinate file carefully. both the two questions can be found in www.gromacs.org/Documentation/Errors

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2楼2017-01-06 16:09:59
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晓杨木木

新虫 (初入文坛)

楼主软件用的怎么样了,初学者请教一下

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3楼2017-02-17 22:07:49
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