| 查看: 1604 | 回复: 16 | |||
[交流]
询问有关引物设计方面的问题
|
|||
|
问有关引物设计方面的问题？ （1）请问引物的Tm值及GC含量的计算是用已经加了酶切位点及保护碱基的引物来计算吗？ （2）所说的引物长度也包含了酶切位点及保护碱基吗？ （3）kozak序列加在引物的什么位置？上下游引物都需要加kozak序列吗？ （4）酶切位点的保护碱基是要在酶切位点两端都要加吗？ 请大家帮忙解答一下，谢谢！ 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有170人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
-
留学--博士招生
已经有15人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
澳门科技大学创新工程学院诚招博士生
+2/138
-
福建师范大学叶应祥课题组招收2026级博士研究生
+2/124
-
山东建筑大学 （市政与环境工程学院）硕士研究生招生啦 静电纺丝纤维与盐水分离应用
+1/90
-
广东工业大学-木质纤维素高值化利用团队招博士研究生
+1/80
-
【全额奖学金+英国博士学位】国科大杭高院Nathan课题组招收2026级联培博士生1名！
+1/46
-
天津城建大学招收物理、化学或者生物调剂生一名，前往天津大学联合培养
+1/46
-
哈尔滨工业大学（深圳）-何自开教授团队诚招化学工程与技术专业博士研究生
+1/31
-
春眠不觉晓
+1/20
-
双一流大学湘潭大学“化工过程模拟与强化”国家地方联合工程研究中心招收各类博士生
+1/16
-
浙江大学光电学院极端光学技术与仪器国家重点实验室诚聘极紫外阿秒方向博士后
+1/15
-
湖南大学微生物结构与功能实验室2026年计划招收博士研究生
+1/13
-
宁夏大学化学化工学院魏逸彬研究员课题组招聘启事
+1/8
-
化学、化工、化妆品、材料背景考生调剂
+1/8
-
天津医科大学基础医学院张恒课题组博士后招聘
+1/8
-
大连理工大学气体监测与环境催化团队诚聘副教授、助理教授及博士后3-4名
+1/7
-
【第三轮招生】澳科大诚招2026年秋季药剂学硕士研究生（3月31日下午18:00截止）
+1/5
-
山东烟台某高校材料专业研究生调剂
+1/4
-
福建师范大学环境与资源学院招收2026级硕士生
+1/1
-
中国人民大学物理学系蔡鹏课题组招收优秀硕士博士研究生
+1/1
-
易度层流质量流量计在天然气校准与泄漏监测中的应用
+1/1
8楼2017-01-01 22:18:41
9楼2017-01-01 22:22:46
10楼2017-01-01 22:22:56
11楼2017-01-01 22:25:32
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
Tm值和GC含量，我一般加酶切位点和不加酶切位点都看，只要Tm值一度以内就可以。保护碱基根据实际情况吧，可以加也可以不加吧。 发自小木虫Android客户端 |
12楼2017-01-01 22:29:01
13楼2017-01-01 22:35:23
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
你的第四个问题，有歧义，如果加的话，就要加在酶切位点的外侧，靠近原序列那测不能加。因为有的酶需保护碱基提供位置支撑点，所以最好加上。 发自小木虫IOS客户端 |
14楼2017-01-02 09:11:15
15楼2017-01-02 15:15:13
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
（1）请问引物的Tm值及GC含量的计算是用已经加了酶切位点及保护碱基的引物来计算吗？ 一般是加酶切位点及保护性碱基前的Tm值和GC含量。 （2）所说的引物长度也包含了酶切位点及保护碱基吗？ 不知道你指的是什么时候的引物长度，如果试验对设计引物长度有要求，应该就不包括酶切位点及保护性碱基。 （3）kozak序列加在引物的什么位置？上下游引物都需要加kozak序列吗？ kozak序列应该是只需加在上游引物的5'端就行。 （4）酶切位点的保护碱基是要在酶切位点两端都要加吗？ 应该是看情况吧，我觉得如果是连加两个或以上酶切位点最好两端都加上吧，毕竟两个酶切位点离得太近对双酶切有一定影响，如 果只加一个酶切位点，我觉得就在一端加就行了，应该是加在5'端。 以上个人经验及理解，仅供参考！  |
16楼2017-01-03 11:39:56
17楼2017-01-03 21:03:32
简单回复
tan9142楼
2017-01-01 19:05
回复
贺夏(金币+1): 谢谢参与
dsctg3楼
2017-01-01 19:20
回复
贺夏(金币+1): 谢谢参与
playman4楼
2017-01-01 20:11
回复
贺夏(金币+1): 谢谢参与
1
青云丹鹤5楼
2017-01-01 20:22
回复
贺夏(金币+1): 谢谢参与
祝福
tzynew6楼
2017-01-01 22:01
回复
贺夏(金币+1): 谢谢参与
2017-01-01 22:11
回复
