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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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czj12345

铁虫 (初入文坛)

[求助] 关于APBS计算结合自由能的问题

本人一新手,想计算抗原抗体的结合自由能。想采用APBS进行计算,但是官网上的关于binding energy的教学我不是很懂。其中有一点是用APBS的coulomb这个插件进行计算,我想问使用什么样的软件可以调用这个插件?之前我试过pymol,但是只能计算表面静电势。哪位大神能够解答我的问题呢,谢谢。

http://www.poissonboltzmann.org/examples/binding_energies/#topcall
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hclwonder

新虫 (正式写手)

3楼中是“然后再计算”,不是“杂合”,打错了。

发自小木虫Android客户端
4楼2017-01-01 11:34:06
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hclwonder

新虫 (正式写手)

apbs计算的并不是完整的binding energy,只是其中一部分。可以见这篇科学网但博文http://wap.sciencenet.cn/blogview.aspx?id=624301

发自小木虫Android客户端
2楼2017-01-01 11:20:30
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