| 查看: 746 | 回复: 3 | ||
[求助]
关于APBS计算结合自由能的问题
|
|
本人一新手，想计算抗原抗体的结合自由能。想采用APBS进行计算，但是官网上的关于binding energy的教学我不是很懂。其中有一点是用APBS的coulomb这个插件进行计算，我想问使用什么样的软件可以调用这个插件？之前我试过pymol，但是只能计算表面静电势。哪位大神能够解答我的问题呢，谢谢。 http://www.poissonboltzmann.org/examples/binding_energies/#topcall |
回复此楼» 猜你喜欢
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福
已经有9人回复
-
CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生｜MSCA经费充足、排名优
已经有6人回复
-
天津大学招2026.09的博士生，欢迎大家推荐交流（博导是本人）
已经有4人回复
-
同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗
已经有3人回复
-
退学或坚持读
已经有28人回复
-
面上项目申报
已经有3人回复
-
酰胺脱乙酰基
已经有9人回复
-
博士延得我，科研能力直往上蹿
已经有7人回复
-
面上基金申报没有其他的参与者成吗
已经有5人回复
-
遇见不省心的家人很难过
已经有22人回复
hclwonder
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2564.1
- 红花: 28
- 帖子: 371
- 在线: 68.2小时
- 虫号: 2837657
- 注册: 2013-11-30
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
|
apbs计算的并不是完整的binding energy，只是其中一部分。可以见这篇科学网但博文http://wap.sciencenet.cn/blogview.aspx?id=624301 发自小木虫Android客户端 |
2楼2017-01-01 11:20:30
hclwonder
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2564.1
- 红花: 28
- 帖子: 371
- 在线: 68.2小时
- 虫号: 2837657
- 注册: 2013-11-30
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
3楼2017-01-01 11:26:50
hclwonder
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2564.1
- 红花: 28
- 帖子: 371
- 在线: 68.2小时
- 虫号: 2837657
- 注册: 2013-11-30
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
4楼2017-01-01 11:34:06