| 查看: 888 | 回复: 3 | ||
[求助]
关于APBS计算结合自由能的问题
|
|
本人一新手，想计算抗原抗体的结合自由能。想采用APBS进行计算，但是官网上的关于binding energy的教学我不是很懂。其中有一点是用APBS的coulomb这个插件进行计算，我想问使用什么样的软件可以调用这个插件？之前我试过pymol，但是只能计算表面静电势。哪位大神能够解答我的问题呢，谢谢。 http://www.poissonboltzmann.org/examples/binding_energies/#topcall |
回复此楼» 猜你喜欢
E0414, 我的本子有没有希望？
已经有7人回复
-
有谁可曾问过你过的还好吗？
已经有17人回复
-
一篇论文同时出现在两个期刊，一模一样，这算不算学术不端，请各位老师斧正。
已经有12人回复
-
希望面上有个好结果
已经有7人回复
-
今年也是没消息就是没中么
已经有16人回复
-
三区计算机方向期刊推荐
已经有5人回复
-
sci论文二审求助
已经有5人回复
-
函评
已经有7人回复
-
买卖文章的刷屏了！
已经有3人回复
hclwonder
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2564.1
- 红花: 28
- 帖子: 371
- 在线: 68.2小时
- 虫号: 2837657
- 注册: 2013-11-30
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
|
apbs计算的并不是完整的binding energy，只是其中一部分。可以见这篇科学网但博文http://wap.sciencenet.cn/blogview.aspx?id=624301 发自小木虫Android客户端 |
2楼2017-01-01 11:20:30
hclwonder
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2564.1
- 红花: 28
- 帖子: 371
- 在线: 68.2小时
- 虫号: 2837657
- 注册: 2013-11-30
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
3楼2017-01-01 11:26:50
hclwonder
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2564.1
- 红花: 28
- 帖子: 371
- 在线: 68.2小时
- 虫号: 2837657
- 注册: 2013-11-30
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
4楼2017-01-01 11:34:06