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larameme

新虫 (初入文坛)

[交流] 新种鉴定 已有5人参与

请问，一株细菌经过16s序列比对分析，与其相邻的模式菌株相似度为98.4%，与其他菌株的相似度都在97%以下，能基本确定该菌株为新种吗？

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1楼 2016-12-27 23:40:49
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
如果序列没问题，根据个人经验，肯定是

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2楼2016-12-28 02:12:58
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二十一业

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
是新种的可能性比较大，具体可以将基因组序列与genebank已知基因组比对ANI试试
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3楼2016-12-28 10:45:40
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larameme

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 二十一业 at 2016-12-28 10:45:40
是新种的可能性比较大，具体可以将基因组序列与genebank已知基因组比对ANI试试

好的，非常感谢

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4楼2016-12-28 16:54:26
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larameme

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuhaolin3 at 2016-12-28 02:12:58
如果序列没问题，根据个人经验，肯定是

嗯，谢谢

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5楼2016-12-28 16:54:56
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张丽娟2012

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
有个韩国标准菌比对网站，貌似拼写Eztaxon，去比一下

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现实总是最美好的
6楼2016-12-29 12:21:36
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cxw0534

铜虫 (正式写手)
★
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需要通过物理化学手段鉴定

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7楼2016-12-29 12:46:18
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gxb527

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
一个新种不能简单比对一个序列（虽然是很重要的指标，但发生了变异呢，或者是生理小种呢），还要比对其生理形态等，与已知种是否有显著不同？？有句话：不可以替代的形态学鉴定和永远不断跟新的分子技术！
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8楼2016-12-29 13:32:26
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