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在一个多重耐药性细菌中，发现存在一个约20kb的质粒，该质粒携带3个基因可能与耐药性有关，请设计实验证明基因与耐药性表型的相关性。 在人类细胞HepG2中，发现有一个重要的基因（如beta-catenin）存在缺失突变，测序证明该缺失是一段300nt的DNA丢失。该缺失突变发生后，该基因产生的mRNA水平升高，请通过实验确定该mRNA水平升高的机理。 已知一个毒素处理动物细胞后，发现该处理后的细胞有多个基因存在明显的上调，其中HAT（组蛋白乙酰化转移酶）存在明显的上调，请设计实验验证组蛋白乙酰化/去乙酰化是否与毒素处理后上调的基因存在相关性。 在环境中分离到一株病原菌，研究发现该病原菌没有明显的毒力蛋白因子，但是能够分泌出一种次生代谢产物（化合物小分子结构），该化合物可以进入宿主细胞产生毒理效应，主要表现为线粒体的损伤，ROS上调，细胞凋亡增加，繁殖能力下降。请结合组学的方法设计实验来说明该代谢产物的生殖毒性是由线粒体损伤，ROS变化引发的。 已知基因A可以被激活调控，在基因A的ORF上游约300nt附近发现存在一个特异DNA序列CCAAT，该序列能够与NFY蛋白复合物结合，请设计实验证明该激活是NFY蛋白调控的。 已知基因A可以被激活调控，在基因A的ORF上游约300nt附近发现存在一个特异DNA序列YYGGCCYY，该序列能够被蛋白C识别。已知蛋白B能够激活A的表达，B蛋白体外已经验证是一个Ser/Thr激酶，具有磷酸化蛋白C的能力，请设计体内实验研究A被B调控的机理，以及B与C的关系。 假如你进入实验室开始研究一个DNA结合蛋白的功能，请设计实验确定： 1. 该编码基因在体内的表达水平和组织/细胞特异性 2. 该蛋白的哪个结构域具有DNA结合功能 3. 如何确认该蛋白在体内的生物学功能 如果你已经获得一个功能未知的基因，如何研究该基因的功能？请根据自己熟悉的某种模式生物提出具体的研究方案。 @biostar2009 发自小木虫Android客户端 |
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