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从没做过分子模拟,请教下我这种情况要学习什么软件? 已有2人参与
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目前做的是纳米药物载体,如DNA折纸结构或小分子蛋白配体,我们对这些结构进行一定修饰,然后负载药物,让它带着药去和细胞膜蛋白特异性结合。 我的老师希望能利用计算机分子模拟软件来模拟DNA折纸或小分子蛋白配体,模拟它们和已知的细胞膜受体蛋白的反应。 DNA折纸的碱基序列或蛋白配体氨基酸序列是已知的,形成的结构在宏观上也已知,但是没有PDB那种三维结构。 请问这种情况要得到DNA折纸或小分子蛋白配体的3维模型,并模拟其与已知大蛋白的结合反应,我应该用什么软件? (最好是免费的或便宜的,之前咨询DS报价要30多万,我们目前没有这个购买力。。) 谢谢 |
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chuntao118
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