24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1320  |  回复: 4

chuxiao9299

新虫 (初入文坛)

[求助] 从没做过分子模拟,请教下我这种情况要学习什么软件? 已有2人参与

目前做的是纳米药物载体,如DNA折纸结构或小分子蛋白配体,我们对这些结构进行一定修饰,然后负载药物,让它带着药去和细胞膜蛋白特异性结合。
我的老师希望能利用计算机分子模拟软件来模拟DNA折纸或小分子蛋白配体,模拟它们和已知的细胞膜受体蛋白的反应。
DNA折纸的碱基序列或蛋白配体氨基酸序列是已知的,形成的结构在宏观上也已知,但是没有PDB那种三维结构。
请问这种情况要得到DNA折纸或小分子蛋白配体的3维模型,并模拟其与已知大蛋白的结合反应,我应该用什么软件?
(最好是免费的或便宜的,之前咨询DS报价要30多万,我们目前没有这个购买力。。)
谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
最好用组里面以前用过的软件。否则将会将完全靠自己来搞定!如果组里没有的话!建议可以学习一下:lammps可以到网站上下载的程序包!我个人建议,参考软件包的内容,但不要盲目的照搬!
2楼2016-12-25 09:12:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuxiao9299

新虫 (初入文坛)

回复晚了,谢谢楼上回答,我们实验室以前没有人做过计算机模拟的,所以确实是从0开始摸索。

发自小木虫Android客户端
3楼2016-12-28 18:18:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

laodifang123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by chuxiao9299 at 2016-12-28 18:18:31
回复晚了,谢谢楼上回答,我们实验室以前没有人做过计算机模拟的,所以确实是从0开始摸索。

我是搞着的额,有NUPACK  ,DSD等
4楼2017-01-06 09:27:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanyoupeng

新虫 (初入文坛)

月只蓝: 应助指数-1, 非应助 2017-09-20 20:45:38
引用回帖:
3楼: Originally posted by chuxiao9299 at 2016-12-28 18:18:31
回复晚了,谢谢楼上回答,我们实验室以前没有人做过计算机模拟的,所以确实是从0开始摸索。

楼主  我们实验室也是没有做过模拟的  请问你的问题解决了吗  使用什么软件做的模拟啊 有没有教程的
5楼2017-09-20 14:43:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chuxiao9299 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085602 化工专硕 338分 求调剂 +12 路痴小琪 2026-03-27 12/600 2026-03-28 15:41 by L135790
[考研] 070305高分子化学与物理 304分求调剂 +4 c297914 2026-03-28 4/200 2026-03-28 15:06 by 果果妈咪
[考研] 一志愿哈尔滨工业大学材料与化工方向336分 +8 辰沐5211314 2026-03-26 8/400 2026-03-28 11:25 by xuxiang
[考研] 311求调剂 +3 希望上岸阿小杨 2026-03-23 3/150 2026-03-28 07:57 by 热情沙漠
[考研] 食品工程专硕一志愿中海洋309求调剂 +3 小张zxy张 2026-03-26 5/250 2026-03-27 18:42 by 小张zxy张
[考研] 298调剂 +3 jiyingjie123 2026-03-27 3/150 2026-03-27 11:57 by wxiongid
[考研] 324求调剂 +5 hanamiko 2026-03-26 5/250 2026-03-27 10:33 by wangjy2002
[考研] 材料调剂 +8 匹克i 2026-03-23 8/400 2026-03-27 08:11 by hypershenger
[考研] 351求调剂 +4 麦克阿磊 2026-03-24 4/200 2026-03-27 00:32 by wxiongid
[考研] 调剂求收留 +7 果然有我 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:26 by wxiongid
[考研] 321求调剂 +6 Ymlll 2026-03-24 6/300 2026-03-26 20:50 by 不吃魚的貓
[考研] 327求调剂 +7 prayer13 2026-03-23 7/350 2026-03-26 20:48 by 不吃魚的貓
[考研] 325求调剂 +3 Aoyijiang 2026-03-23 3/150 2026-03-26 20:46 by 不吃魚的貓
[考研] 【双一流院校新能源、环境材料,材料加工与模拟招收大量调剂】 +4 Higraduate 2026-03-22 8/400 2026-03-26 20:34 by Higraduate
[考研] 0854AI CV方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-23 4/200 2026-03-25 17:04 by CoderLoser
[考研] 302求调剂 +4 锦衣卫藤椒 2026-03-25 4/200 2026-03-25 16:29 by 功夫疯狂
[考研] 材料调剂 +3 iwinso 2026-03-23 3/150 2026-03-25 11:29 by greychen00
[考研] 一志愿吉大化学322求调剂 +4 17501029541 2026-03-23 6/300 2026-03-24 10:21 by 戴围脖的小蚊子
[考研] 一志愿070300浙大化学358分,求调剂! +4 酥酥鱼.. 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:12 by Iveryant
[考研] 306求调剂 +5 来好运来来来 2026-03-22 5/250 2026-03-22 16:17 by BruceLiu320
信息提示
请填处理意见