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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】做构想搜索用什么软件比较好呢
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jingyybuaa

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】做构想搜索用什么软件比较好呢

新手求助
rt
而且是在windows系统下。
谢谢

[ Last edited by zdhlover on 2009-12-14 at 13:50 ]
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1楼 2008-12-09 21:46:58
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★
gwdavid(金币+2,VIP+0):谢谢！
自己编
例如，一种基于信息熵的多种群遗传算法
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2楼2008-12-09 22:00:41
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
yalefield 您好，请问您有现成的搜索分子构象的软件吗？最好是linux下的。能不能给我发一份，谢谢wuhanhgf2002@yahoo.com.cn
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3楼2008-12-10 08:33:47
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★ ★ ★
gwdavid(金币+4,VIP+0):谢谢关注
不知道你哪里是什么环境。
如果有大型软件，如Tripos Sybyl或者Accelrys Discovery Studio等，完全可以进行。
小型的，也有很多......
还有，你要达到什么目的？
量化还是分子力学？或动力学？

量化方面：
从头计算：Gaussian, GAMESS等，或者NWChem(并行)
半经验：AMPAC, MOPAC, ZINDO等

分子力学：AMBER, CHARMm...TINKER等
分子动力学：GRAMACS, NAME, DL_POLY等
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4楼2008-12-10 08:56:50
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jingyybuaa

铜虫 (小有名气)
我的电脑配置不太高，主要想做一个甲基环己烷的构象搜索。请问有没有现成的软件？能发给我一份吗？我的邮箱jingyybuaa@yahoo.cn
高斯也能做吗？是怎么实现的呢？谢谢
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5楼2008-12-10 18:03:00
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论！
依俺看，你还是盗版Hyperchem吧。
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6楼2008-12-10 18:07:15
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jingyybuaa

铜虫 (小有名气)
CHARMm呢？大虾有CHARMm吗？
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7楼2008-12-10 18:25:40
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