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二十一业

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
11石宝: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-12-29 14:16:23
引用回帖:
19楼: Originally posted by 11石宝 at 2016-12-28 13:40:34
目前问过的做测序草图的价格和DNA杂交的价格差不多，Piscinibacter defluvii从韩国进口的，那边的作者发邮件都没有回复的。因为不能确定是否为新种，合理的价格选择方式好像只能先做DNA杂交了。...

你可以选择先做杂交实验
同时你做之前，要考虑一下，做了如果是同种，下游还需要做什么；如果不是同种，下游还需要做什么。
考虑完之后，你才能清楚的知道自己需要做什么
草图价格现在市场价估计是2500-5000不等
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21楼2016-12-28 14:01:51
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
18楼: Originally posted by 二十一业 at 2016-12-28 10:41:05
赞。问一下哪里可以测，哪里可以分析呀...

一般的高通量测序公司都行吧。我一年前测了三个基因组，基因组大小6Mb多点。二代双端测序，构建了一个400bp小片段文库(每个文库1200RMB)，共测了3Gb数据(400RMB/Gb)，150X了。自己使用VAGUE(Velvet的图形化界面版)拼接，每个约300 contigs，N50约50kb；又用PROKKA软件进行了简单注释。足够使用了。

最近问几个测序公司，说每个基因组1000RMB就能搞定…

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做一个阳光、开朗的小和尚
22楼2016-12-28 14:53:25
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
20楼: Originally posted by 11石宝 at 2016-12-28 13:45:20
这个是？能具体科普下么，谢谢。...

一般的高通量测序公司都行吧。我一年前测了三个基因组，基因组大小6Mb多点。二代双端测序，构建了一个400bp小片段文库(每个文库1200RMB)，共测了3Gb数据(400RMB/Gb)，150X了。自己使用VAGUE(Velvet的图形化界面版)拼接，每个约300 contigs，N50约50kb；又用PROKKA软件进行了简单注释。足够使用了。

最近问几个测序公司，说每个基因组1000RMB就能搞定…

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做一个阳光、开朗的小和尚
23楼2016-12-28 14:56:21
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二十一业

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
22楼: Originally posted by zhaozhibozhi at 2016-12-28 14:53:25
一般的高通量测序公司都行吧。我一年前测了三个基因组，基因组大小6Mb多点。二代双端测序，构建了一个400bp小片段文库(每个文库1200RMB)，共测了3Gb数据(400RMB/Gb)，150X了。自己使用VAGUE(Velvet的图形化界面版) ...

一次样本量很多的话才可能1000吧，你问的哪些公司1000能搞定呀
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24楼2016-12-29 14:19:39
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
24楼: Originally posted by 二十一业 at 2016-12-29 14:19:39
一次样本量很多的话才可能1000吧，你问的哪些公司1000能搞定呀...

给的宣传单已经进垃圾桶了……
你可以多咨询几个。。

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做一个阳光、开朗的小和尚
25楼2016-12-30 01:34:44
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