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suny2005

木虫 (小有名气)

[交流] [求助]tinker软件中如何看频率振动

我用tinker软件计算了一个分子的频率,但是不知道这些计算得到的频率值所对应的振动模式!请问大家有知道如何在tinker软件中看频率振动的吗?谢谢!
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suny2005

木虫 (小有名气)

是原子的的振动频率? 我想看键伸缩和弯曲振动应该用哪个选项?我是用的vibrate这个选项算的!我想和gaussian得到的振动频率进行对照!
7楼2008-12-11 08:50:47
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...


gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢!
gview中的result里面可以看到,你可以下一个gaussian view
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
2楼2008-12-09 16:50:42
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

你要看这个干嘛呢?
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
3楼2008-12-09 16:50:54
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suny2005

木虫 (小有名气)

我用GV打不开呢!我想做力场,拟合振动频率,是我的log文件有问题吗?

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##             TINKER  ---  Software Tools for Molecular Design             ##
##                                                                          ##
##                          Version 4.2  June 2004                          ##
##                                                                          ##
##               Copyright (c)  Jay William Ponder  1990-2004               ##
##                            All Rights Reserved                           ##
##                                                                          ##
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Eigenvalues of the Hessian Matrix :

    1   -0.001     2   -0.001     3    0.000     4    0.000     5    0.000
    6    0.001     7   12.075     8   17.137     9   46.762    10   98.889
   11  116.954    12  141.014    13  168.955    14  224.207    15  267.424
   16  297.915    17  310.149    18  384.452    19  459.898    20  864.332
   21 1526.941    22 1692.676    23 1824.624    24 2111.066    25 2183.081
   26 2434.051    27 3524.108


Vibrational Frequencies (cm-1) :

    1    1.162I    2    1.043I    3    0.000     4    0.000     5    0.000
    6    1.081     7  167.722     8  341.349     9  355.341    10  467.356
   11  536.111    12  568.326    13  923.442    14 1013.456    15 1034.005
   16 1129.989    17 1205.233    18 1209.950    19 1366.586    20 1469.400
   21 1510.765    22 1594.580    23 1780.276    24 2915.668    25 2992.318
   26 3300.691    27 3331.181
就只有这些内容!
4楼2008-12-09 20:38:48
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