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[求助]tinker软件中如何看频率振动
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| 我用tinker软件计算了一个分子的频率，但是不知道这些计算得到的频率值所对应的振动模式！请问大家有知道如何在tinker软件中看频率振动的吗？谢谢！ |
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2楼2008-12-09 16:50:42
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3楼2008-12-09 16:50:54
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我用GV打不开呢！我想做力场，拟合振动频率，是我的log文件有问题吗？ ############################################################################## ############################################################################## ## ## ## TINKER --- Software Tools for Molecular Design ## ## ## ## Version 4.2 June 2004 ## ## ## ## Copyright (c) Jay William Ponder 1990-2004 ## ## All Rights Reserved ## ## ## ############################################################################## ############################################################################## Eigenvalues of the Hessian Matrix : 1 -0.001 2 -0.001 3 0.000 4 0.000 5 0.000 6 0.001 7 12.075 8 17.137 9 46.762 10 98.889 11 116.954 12 141.014 13 168.955 14 224.207 15 267.424 16 297.915 17 310.149 18 384.452 19 459.898 20 864.332 21 1526.941 22 1692.676 23 1824.624 24 2111.066 25 2183.081 26 2434.051 27 3524.108 Vibrational Frequencies (cm-1) : 1 1.162I 2 1.043I 3 0.000 4 0.000 5 0.000 6 1.081 7 167.722 8 341.349 9 355.341 10 467.356 11 536.111 12 568.326 13 923.442 14 1013.456 15 1034.005 16 1129.989 17 1205.233 18 1209.950 19 1366.586 20 1469.400 21 1510.765 22 1594.580 23 1780.276 24 2915.668 25 2992.318 26 3300.691 27 3331.181 就只有这些内容！ |
4楼2008-12-09 20:38:48
5楼2008-12-10 18:01:36
rrjjp1107
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jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论！
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Vibrational Frequencies (cm-1) : 1 1.162I 2 1.043I 3 0.000 4 0.000 5 0.000 6 1.081 7 167.722 8 341.349 9 355.341 10 467.356 11 536.111 12 568.326 13 923.442 14 1013.456 15 1034.005 16 1129.989 17 1205.233 18 1209.950 19 1366.586 20 1469.400 21 1510.765 22 1594.580 23 1780.276 24 2915.668 25 2992.318 26 3300.691 27 3331.181 这些应该就是各原子震动频率。 我没做。但也有用过一点tinker。这些序号应该是原子的。这个分子够大的。 化学上有伸缩震动和弯曲震动之分。正在学习tinker |
6楼2008-12-10 20:16:34
7楼2008-12-11 08:50:47
yyx19840628
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8楼2008-12-11 08:59:33
9楼2008-12-14 13:57:06
rrjjp1107
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更正
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gwdavid(金币+1):谢谢！
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呵呵，抱歉，近来忙着考试一直没再看帖子。 上回我说的不很准确。 Vibrational Frequencies (cm-1) : 1 1.162I 2 1.043I 3 0.000 4 0.000 5 0.000 6 1.081 7 167.722 8 341.349 9 355.341 10 467.356 11 536.111 12 568.326 13 923.442 14 1013.456 15 1034.005 16 1129.989 17 1205.233 18 1209.950 19 1366.586 20 1469.400 21 1510.765 22 1594.580 23 1780.276 24 2915.668 25 2992.318 26 3300.691 27 3331.181 这些是分子各键的震动转动频率。 一个分子的自由度为3N-6(线形分子3N-5)，键的这些震动频率都会在这里出现。上回说的不很准 |
10楼2009-01-09 13:54:07