应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » Pymol在选择Ca时 defined with 0 atoms.”怎么办呢？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1450  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

鸿鹄00000

银虫 (小有名气)

[求助] Pymol在选择Ca时 defined with 0 atoms.”怎么办呢？ 已有1人参与

Pymol在选择Ca时“select carbon, name ca”总显示“Selector: selection "carbon" defined with 0 atoms.”怎么办呢？
回复此楼

» 猜你喜欢
好好学习，天天向上
1楼 2016-12-21 11:01:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

puluo-880312

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 鸿鹄00000 at 2016-12-22 23:24:38
这个Ca是α碳，不是钙
...

用word打开pdb，看看pdb中的名字是什么！
ATOM     96  CA  CYS A  15      21.565   7.335  47.731  1.00 21.92           C  
ATOM     97  C   CYS A  15      21.715   6.431  46.504  1.00 21.98           C  
ATOM     98  O   CYS A  15      21.085   5.381  46.561  1.00 22.66           O  
ATOM     99  CB  CYS A  15      20.398   8.302  47.468  1.00 21.17           C  
ATOM    100  SG  CYS A  15      20.846   9.585  46.269  1.00 21.78           S  
ATOM    101  N   ALA A  16      22.540   6.753  45.495  1.00 22.13           N  
ATOM    102  CA  ALA A  16      22.738   5.972  44.294  1.00 21.96           C  
ATOM    103  C   ALA A  16      21.520   5.216  43.808  1.00 22.74           C  
ATOM    104  O   ALA A  16      21.412   3.982  43.830  1.00 22.78           O  
比如上面的确实是CA，则可以select carbon, name ca或者select atom, name ca，这样都可以选择你需要的α-C，要以pdb中的为准
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2016-12-23 12:14:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

puluo-880312

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
确定sequence中的name为ca？或者不用输代码，直接在sequence中选择，其为单独的一个sele，然后把该sele重命名为ca，在该sele中进行鼠标操作就可以了
赞一下 回复此楼
2楼2016-12-22 09:08:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

鸿鹄00000

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by puluo-880312 at 2016-12-22 09:08:58
确定sequence中的name为ca？或者不用输代码，直接在sequence中选择，其为单独的一个sele，然后把该sele重命名为ca，在该sele中进行鼠标操作就可以了

一个蛋白，四百多氨基酸，难不成都一个一个点啊？又没有快选的呢

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
好好学习，天天向上
3楼2016-12-22 23:22:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

鸿鹄00000

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 鸿鹄00000 at 2016-12-22 23:22:36
一个蛋白，四百多氨基酸，难不成都一个一个点啊？又没有快选的呢
...

这个Ca是α碳，不是钙

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
好好学习，天天向上
4楼2016-12-22 23:24:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 本科双非材料，跨考一志愿华电085801电气，283求调剂，任何专业都可以 +5 芝士雪baoo 2026-03-28 6/300 2026-03-28 15:25 by 1018329917
[考研] 320分，材料与化工专业，求调剂 +9 一定上岸aaa 2026-03-27 13/650 2026-03-28 15:00 by 神马都不懂
[考研] 求调剂 +3 QiMing7 2026-03-25 4/200 2026-03-28 14:30 by QiMing7
[考研] 329求调剂 +6 星野? 2026-03-26 6/300 2026-03-28 14:14 by 唐沐儿
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-27 6/300 2026-03-28 14:10 by 唐沐儿
[考研] 0703一志愿9，初试成绩：338，四六级已过，有科研经历，求调剂！ +4 Zuhui0306 2026-03-25 4/200 2026-03-28 13:07 by 唐沐儿
[考研] 277跪求调剂 +5 1915668 2026-03-27 9/450 2026-03-28 09:58 by zhshch
[考研] 289求调剂 +10 新时代材料 2026-03-27 10/500 2026-03-28 09:53 by 无际的草原
[考研] 272求调剂 +7 脚滑的守法公民 2026-03-27 7/350 2026-03-27 17:23 by laoshidan
[考研] 287求调剂 +10 land xuxu 2026-03-26 10/500 2026-03-27 15:33 by 帕尔马拉特
[考研] 调剂推荐 +5 清酒714 2026-03-26 6/300 2026-03-27 11:12 by 不吃魚的貓
[考研] 求调剂323材料与化工 +7 1124361 2026-03-24 7/350 2026-03-27 10:22 by wangjy2002
[考研] 求调剂 +6 林之夕 2026-03-24 6/300 2026-03-27 08:38 by hypershenger
[考研] 349求调剂 +4 李木子啊哈哈 2026-03-25 4/200 2026-03-26 22:49 by fmesaito
[考研] 333求调剂 +6 wfh030413@ 2026-03-23 6/300 2026-03-26 22:45 by 学员8dgXkO
[考研] 【双一流院校新能源、环境材料，材料加工与模拟招收大量调剂】 +4 Higraduate 2026-03-22 8/400 2026-03-26 20:34 by Higraduate
[考研] 资源与环境 调剂申请(333分) +9 holy J 2026-03-21 9/450 2026-03-26 15:47 by 161765490
[考研] 一志愿南航 335分 | 0856材料化工 | GPA 4.07 | 有科研经历 +6 cccchenso 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:25 by 544594351
[考研] 生物学学硕求调剂 +7 小羊睡着了? 2026-03-23 10/500 2026-03-25 02:24 by 清风拂扬。 m
[考研] 335求调剂 +4 yuyu宇 2026-03-23 5/250 2026-03-23 23:49 by Txy@872106
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭