应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » Pymol在选择Ca时 defined with 0 atoms.”怎么办呢？
61/1返回列表
查看: 1560  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

鸿鹄00000

银虫 (小有名气)

[求助] Pymol在选择Ca时 defined with 0 atoms.”怎么办呢？ 已有1人参与

Pymol在选择Ca时“select carbon, name ca”总显示“Selector: selection "carbon" defined with 0 atoms.”怎么办呢？
回复此楼

» 猜你喜欢
好好学习，天天向上
1楼 2016-12-21 11:01:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

puluo-880312

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
确定sequence中的name为ca？或者不用输代码，直接在sequence中选择，其为单独的一个sele，然后把该sele重命名为ca，在该sele中进行鼠标操作就可以了
赞一下 回复此楼
2楼2016-12-22 09:08:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

鸿鹄00000

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by puluo-880312 at 2016-12-22 09:08:58
确定sequence中的name为ca？或者不用输代码，直接在sequence中选择，其为单独的一个sele，然后把该sele重命名为ca，在该sele中进行鼠标操作就可以了

一个蛋白，四百多氨基酸，难不成都一个一个点啊？又没有快选的呢

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
好好学习，天天向上
3楼2016-12-22 23:22:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

鸿鹄00000

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 鸿鹄00000 at 2016-12-22 23:22:36
一个蛋白，四百多氨基酸，难不成都一个一个点啊？又没有快选的呢
...

这个Ca是α碳，不是钙

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
好好学习，天天向上
4楼2016-12-22 23:24:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

puluo-880312

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 鸿鹄00000 at 2016-12-22 23:24:38
这个Ca是α碳，不是钙
...

用word打开pdb，看看pdb中的名字是什么！
ATOM     96  CA  CYS A  15      21.565   7.335  47.731  1.00 21.92           C  
ATOM     97  C   CYS A  15      21.715   6.431  46.504  1.00 21.98           C  
ATOM     98  O   CYS A  15      21.085   5.381  46.561  1.00 22.66           O  
ATOM     99  CB  CYS A  15      20.398   8.302  47.468  1.00 21.17           C  
ATOM    100  SG  CYS A  15      20.846   9.585  46.269  1.00 21.78           S  
ATOM    101  N   ALA A  16      22.540   6.753  45.495  1.00 22.13           N  
ATOM    102  CA  ALA A  16      22.738   5.972  44.294  1.00 21.96           C  
ATOM    103  C   ALA A  16      21.520   5.216  43.808  1.00 22.74           C  
ATOM    104  O   ALA A  16      21.412   3.982  43.830  1.00 22.78           O  
比如上面的确实是CA，则可以select carbon, name ca或者select atom, name ca，这样都可以选择你需要的α-C，要以pdb中的为准
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2016-12-23 12:14:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

鸿鹄00000

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by puluo-880312 at 2016-12-23 12:14:05
用word打开pdb，看看pdb中的名字是什么！
ATOM     96  CA  CYS A  15      21.565   7.335  47.731  1.00 21.92           C  
ATOM     97  C   CYS A  15      21.715   6.431  46.504  1.00 21.98           ...

谢谢！

发自小木虫Android客户端
回复此楼
好好学习，天天向上
6楼2016-12-25 09:11:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 鸿鹄00000 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 朋友圈看到的 +4 wangzilk 2026-08-18 5/250 2026-08-18 19:25 by wangzilk
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +51 医学老男孩 2026-08-13 110/5500 2026-08-18 19:07 by icerianxia
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +8 基诺咪客 2026-08-17 11/550 2026-08-18 17:13 by 悠然熊猫
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +9 yuleib84 2026-08-18 10/500 2026-08-18 16:52 by archvillain
[教师之家] 两姐妹，一个辛辛苦苦30岁工作当大学教师，另一个23岁就工作当开车教练 +3 瞬息宇宙 2026-08-11 7/350 2026-08-18 16:42 by LNP@mRNA
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 8/400 2026-08-18 11:47 by gltch
[基金申请] 快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。 +4 Tide man 2026-08-14 5/250 2026-08-18 11:35 by Tide man
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭