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雪野千树

新虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学模拟如何合并文件 已有1人参与

在分子动力学模拟(gromacs)中,如何将受体与配体的pdb文件合并成一个,以及如何将配体小分子写入top文件。

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飞天ssp

新虫 (职业作家)

hh
2楼2016-12-19 00:23:08
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雪野千树

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 飞天ssp at 2016-12-19 00:23:08
分层建模

能详细介绍吗

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3楼2016-12-19 06:57:59
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gredream

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

4楼2016-12-19 08:33:44
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LeeGenuine

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

分别建模,然后把pdb文件中的坐标copy到一个文件里就好了,后续需要一些处理,修改原子数目,删除重合部分的水等等。总之,都是坐标文件,把所有的坐标放一个文件就好了。
博学之,审问之,慎思之,明辨之,笃行之
5楼2016-12-27 16:51:42
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