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缘木得猫

新虫 (小有名气)

[求助] 晶胞中异族原子的替换 已有1人参与

Materials studio 中设置晶胞中替换都是原子替换,那么异族的原子之间价电子不同,替换之后整个体系的价电子可能有变化,会不会导致体系带电荷?并且,我有点不理解,实际过程中的替换都是离子替换,比如:Al3+被Mg2+替换,替换后,整个体系是显负价的,需要正电荷离子来平衡。但建模的过程中因为是原子替换,则Al被Mg替换,替换前后,整个体系价电子数反而减少了,体系应该是带正电,那么问题到底出在哪里?是我理解错了吗?怎么建立跟实际相同的模型呢?
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缘木得猫

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by jpchou at 2016-12-15 16:54:28
你問的問題~ 層次有點複雜

1. 目前 DFT 計算, 系統"一定一定一定" 只能在 neutral 的狀態
    任何帶正負電的情況是無法直接計算
    所以當改變 NELECT 使的系統帶正點或負電時
    計算軟體 (VA ...

直接在castep中选中原子后,选择properties-charge可以设置原子带电荷,设置某个原子为1,然后导出成POSCAR,用vasp静态计算后,grep ‘NELECT'  OUTCAR,之后发现价电子数的确减少了。或者建立个晶胞,中间放入原子,设置charge按钮,改变设置为1,计算,得到的结果中,布居显示,该原子是带正电荷,然后复制这个原子,粘贴到超胞真空层中。我个人觉得这两种方法都是可行的。
我开始的设想,我没表达清楚。开始要表达的意思是:实际晶体中,我们说替换都是离子替换,比如Al3+被Mg2+替换,替换后,体系带负电荷。但是建模的过程中,我们替换都是在castep中直接选择原子,然后modify element,原子替换,则Al被Mg替换之后,体系反而价电子减少,比如价电子由200变为199。我觉得,这不符合实际的情况,连体系正负电性都变了。所以,我觉得是否能够设置NELECT=200+1,这样体系相比于200的价电子体系,就是负的,这样就符合实际了,但时又会导致整个体系是呈负电的,为了平衡电荷,所以会添加个带正电荷的原子在真空层,这也是实际晶体离子替换后,有阳离子吸附在晶体表面的正常现象。
看了您的回答了,我有点懵了。意思是不管怎么替代,不设置NELECT,系统是neutral状态,可以计算。设置NELECT,系统在背景加入假反向电荷,系统还是neutral状态。这样,就可以计算。那怎么考虑物理上的问题,我要怎么做才能达到符合实际情况呢?或者根本达不到实际情况?有点没理解您的意思。
7楼2016-12-15 20:58:42
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
缘木得猫(漫天飘雪代发): 金币+5, 谢谢交流 2016-12-14 22:09:30
但建模的过程中因为是原子替换,则Al被Mg替换,替换前后,整个体系价电子数反而减少了,体系应该是带正电,那么问题到底出在哪里?是我理解错了吗?

你的問題裡面有一個問題,很重要的問題
以你的例子?碚f, Al 被 Mg 替換
是整個系統所有的 Al 全被 Mg 替換?
還是整個系統中單一顆 (或 n 顆) Al 被 Mg 替換?

後者的話,那你的理解就沒問題
整個系統的其中一個 Al (13 個價電子) 若是被 Mg (12 個價電子) 替換
那系統就會帶 +1 電荷 (少一個價電子)

若是前者
比方 graphene,unit cell 中會有兩顆 C (4個價電子)
其中一顆 C 若是被 N (5個價電子) 取代
那形成的材料叫 CN (carbon nitride)
或是 CN 的 C 被 B 取代
那形成了 BN (boron nitride)
這樣?K不會出現 帶電的問題
因為它會形成不同的結構,是不同的材料
2楼2016-12-14 21:06:50
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缘木得猫

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2016-12-14 21:06:50
但建模的过程中因为是原子替换,则Al被Mg替换,替换前后,整个体系价电子数反而减少了,体系应该是带正电,那么问题到底出在哪里?是我理解错了吗?

你的問題裡面有一個問題,很重要的問題
以你的例子?碚f, Al ...

不好意思,jpchou大神,我没说清楚,1.意思是整个系统中一个Al被Mg替换。2.但是还是有问题,实际过程中是Al3+被Mg2+替换,导致体系带负电荷,我可不可以在用Al原子被Mg替换之后,设置NELECT=中性价电子+1来使得整个体系显负电来与实际匹配呢?但这样做,因为我的是超胞带真空层,会导致静电排斥力吧?(我看过您有个帖子的回复)。所以,我干脆设置NELECT=中性价电子+1,然后再在真空层加1个带正电荷阳离子,这样整个体系也电荷平衡了。不知道这么做对不对?您的看法呢?
3楼2016-12-15 08:14:43
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4楼2016-12-15 08:21:34
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