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swmwww

新虫 (初入文坛)

[求助] 功能基因

最近在做V3-V4区的高通量测序,还想做一下功能基因相关的内容,比如我们做的是土壤中多环芳烃的降解,怎么才能从测序得出的菌种中筛选出可以降解多环芳烃的菌种以及通过哪种手段可以知道哪些功能基因参与了降解过程呢?对分子生物不熟,入门级,求大家指教!

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麦冬麦咚咚

新虫 (初入文坛)



西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-12-18 23:06:02
V3-V4区高通量测序就是扩增子测序,这个在菌群分析和丰度分析用的比较多,功能基因好像不是做V3-V4测序吧

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2楼2016-12-18 22:19:01
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swmwww

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 麦冬麦咚咚 at 2016-12-18 22:19:01
V3-V4区高通量测序就是扩增子测序,这个在菌群分析和丰度分析用的比较多,功能基因好像不是做V3-V4测序吧

恩,前几天咨询了一下别人,说是要做宏基因组,不过一个样很贵。

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3楼2016-12-19 09:20:39
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麦冬麦咚咚

新虫 (初入文坛)


4楼2016-12-19 10:09:23
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star013

新虫 (知名作家)


5楼2016-12-19 15:26:44
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swmwww

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 麦冬麦咚咚 at 2016-12-19 10:09:23
6000-7000左右吧

嗯嗯,功能基因只能通过宏基因组确定出来吗?

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6楼2016-12-19 16:55:01
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beer胖

新虫 (小有名气)

我也想问同样的问题,如何找出具有某一特定功能的基因?
7楼2016-12-21 18:22:59
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free傻孩子

铁虫 (初入文坛)

我们导师直接做基因芯片

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一片冰心在玉壶
8楼2016-12-21 18:34:19
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