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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » pwscf计算能带出错
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by Amersly at 2016-12-10 15:37:42
openmpi安装：
1 下载至download目录 然后在~/下新建并解压至openmpi-1.10.2文件夹tar zxvf openmpi-1.10.2.tar.gz；
2 进入安装文件目录
      cd openmpi-1.10.2
3 使用configure配置，prefix指定安装目录， ...

./configure --prefix=/opt/openmpi-165 CC=icc CXX=icpc FC=ifort F77=ifort
export MPI_HOME=/opt/openmpi-1.10.2
确定只是因为抄袭的问题，本身并没有写错么？
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思想重于技巧，内涵重于表象
11楼2016-12-10 15:47:44
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Amersly

新虫 (小有名气)
我后面粘贴的那个是原网页的 我的版本是1.10.2

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12楼2016-12-10 18:15:39
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Amersly

新虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by souledge at 2016-12-10 15:47:44
./configure --prefix=/opt/openmpi-165 CC=icc CXX=icpc FC=ifort F77=ifort
export MPI_HOME=/opt/openmpi-1.10.2
确定只是因为抄袭的问题，本身并没有写错么？...

那句话opebmpi165应该是openmpi-1.10.2是我粘贴错了

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13楼2016-12-10 18:17:14
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小蜗牛要努力
66

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14楼2016-12-10 18:24:32
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zx2012


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15楼2016-12-10 18:33:57
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

第一处错误，出现在iotk_files.f90的这里：
CODE:
    open(unit=unit,file=file,status=status,form=form,position="rewind",iostat=iostat,action="write")
    if(iostat/=0) then
      call iotk_error_issue(ierrl,"iotk_open_write",__FILE__,__LINE__)
      call iotk_error_msg(ierrl,"CVS Revision: 1.20 ")
      call iotk_error_msg(ierrl,'Error opening file')
      call iotk_error_write(ierrl,"unit",unit)
      call iotk_error_write(ierrl,"file",file)
      call iotk_error_write(ierrl,"binary",lbinary)
      call iotk_error_write(ierrl,"new",lnew)
      call iotk_error_write(ierrl,"iostat",iostat)

存在这个错误，说明需要打开的文件没有被正确打开，导致iostat非零。
第二个错误虽然发生在iotk_scan.f90，但是与第一个问题非常类似：
CODE:
  read(unit,"(a)",iostat=iostat) buffer
  if(iostat/=0) then
    call iotk_error_issue(ierrl,"iotk_getline",__FILE__,__LINE__)
    call iotk_error_msg(ierrl,"CVS Revision: 1.23 ")
    call iotk_error_msg(ierrl,'')
    call iotk_error_write(ierrl,"iostat",iostat)
    goto 2
  end if

这次是发生在读取文件的数据段时，报错。如果我们认为它们是相互关联的，那么基本就是说，从一开头打开文件就没对，后面的也甭说了……
所以，现在看起来不是OpenMPI的问题，而且QE自带例子没有问题的前提下，我们至少还需要如下信息来做筛选：
QE的编译方式（使用什么编译器，有没有什么特别的编译参数，编译过程有没有出现诡异的错误提示）
QE在什么时候出错（做什么任务，进行到哪一步出错，所有的贋势文件等都保证没有问题，同一个QE在多核和单核运行，也就是不使用mpirun调用时是否有报错差异）
QE安装在了什么地方，当前计算的又是什么地方，有没有权限不匹配的问题（比如缺乏写权限）
除了这一个任务外，是否尝试过其他任务；如果做其他的任务，是否会出一样的错误。
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思想重于技巧，内涵重于表象
16楼2016-12-10 20:19:58
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Amersly

新虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by souledge at 2016-12-10 20:19:58
第一处错误，出现在iotk_files.f90的这里：

    open(unit=unit,file=file,status=status,form=form,position="rewind",iostat=iostat,action="write"
    if(iostat/=0) then
      cal ...

现在是例子也不能运行了。我打算连系统加软件一起重装。想请教下要想正确编译qe，在之前需要有哪些软件准备？如果有写的比较全的网站 可以推荐下！多谢

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17楼2016-12-10 21:22:28
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zhbfuck

新虫 (初入文坛)
electrons下面少了一行命令

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18楼2017-07-27 17:42:45
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快乐飞扬

新虫 (正式写手)
大牛 大牛

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19楼2021-12-25 18:47:35
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