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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » pwscf计算能带出错
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Amersly

新虫 (小有名气)

[求助] pwscf计算能带出错 已有2人参与

QE自带的Si示例是可以运行的 但是我自己建的mos2运行却一直出现如下错误：
########################################
# WARNING: there are pending errors
# PENDING ERROR (ierr=1)
# ERROR IN: iotk_open_write (iotk_files.f90:341)
# CVS Revision: 1.20
# Error opening file
unit=90000
file=/home/luyaosong/espresso/pseudo/.x
binary=F
new=F
iostat=2
# FROM IOTK LIBRARY, VERSION 1.2.0
# UNRECOVERABLE ERROR (ierr=3)
# ERROR IN: iotk_getline (iotk_scan.f90:947)
# CVS Revision: 1.23
#
iostat=5001
# ERROR IN: iotk_scan_tag (iotk_scan.f90:593)
# CVS Revision: 1.23
# ERROR IN: iotk_scan (iotk_scan.f90:821)
# CVS Revision: 1.23
# ERROR IN: iotk_scan_end (iotk_scan.f90:241)
# CVS Revision: 1.23
# foundl
########################################################################################################################
对于第一个错误 iotk_open 一直不知道问题出在哪里 望大家可以提示一下！
下面两个错误 看到其他虫友讨论说是只装了 IFORT未安装ICC，所以正在下载，不知道能否解决！
跪求大家帮忙！！
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1楼 2016-12-08 12:21:46
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Amersly

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by souledge at 2016-12-10 00:23:45
不要把outdir和pseudo_dir放在一起，计算时程序会自动将pseudo_dir中的赝势文件拷贝到outdir中，如果在一起，会将原有的赝势删除并且留个空文件。...

我又重装了下openmpi 刚才的错误没有 但是并行编译的时候仍有原来的错误：
重新安装openmpi后并行编译 仍出错
#############################################################################################################################
# WARNING: there are pending errors
# PENDING ERROR (ierr=1)
# ERROR IN: iotk_open_write (iotk_files.f90:341)
# CVS Revision: 1.20
# Error opening file
unit=90000
file=/home/luyaosong/espresso/pseudo/.x
binary=F
new=F
iostat=2
# FROM IOTK LIBRARY, VERSION 1.2.0
# UNRECOVERABLE ERROR (ierr=3)
# ERROR IN: iotk_getline (iotk_scan.f90:947)
# CVS Revision: 1.23
#
iostat=5001
# ERROR IN: iotk_scan_tag (iotk_scan.f90:593)
# CVS Revision: 1.23
# ERROR IN: iotk_scan (iotk_scan.f90:821)
# CVS Revision: 1.23
# ERROR IN: iotk_scan_end (iotk_scan.f90:241)
# CVS Revision: 1.23
# foundl
########################################################################################################################
########################################################################################################################
# WARNING: there are pending errors
# PENDING ERROR (ierr=1)
# ERROR IN: iotk_open_write (iotk_files.f90:341)
# CVS Revision: 1.20
# Error opening file
unit=90000
file=/home/luyaosong/espresso/pseudo/.x
binary=F
new=F
iostat=2
# FROM IOTK LIBRARY, VERSION 1.2.0
# UNRECOVERABLE ERROR (ierr=3)
# ERROR IN: i###################################################################################################################
# WARNING: there are pending errors
# PENDING ERROR (ierr=1)
# ERROR IN: iotk_open_write (iotk_files.f90:341)
# CVS Revision: 1.20
# Error opening file
unit=90000
file=/home/luyaosong/espresso/pseudo/.x
binary=F
new=F
iostat=2
# FROM IOTK LIBRARY, VERSION 1.2.0
# UNRECOVERABLE ERROR (ierr=3)
# ERROR IN: iotk_getline (iotk_scan.f90:947)
# CVS Revision: 1.23
#
iostat=5001
# ERROR IN: iotk_scan_tag (iotk_scan.f90tk_getline (iotk_scan.f90:947)
# CVS Revision: 1.23
#
iostat=5001
# ERROR IN: iotk_scan_tag (iotk_scan.f90:593)
# CVS Revision: 1.23
# ERROR IN: iotk_scan (iotk_scan.f90:821)
# CVS Revision: 1.23
# ERROR IN: iotk_scan_end (iotk_scan.f90:241)
# CVS Revision: 1.23
# foundl
是不是QE没装完整呀！
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8楼2016-12-10 15:03:49
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souledge

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
# Error opening file
unit=90000
file=/home/luyaosong/espresso/pseudo/.x
binary=F
new=F
iostat=2

确定输入文件都没有错？
赞一下 回复此楼
思想重于技巧，内涵重于表象
2楼2016-12-08 15:24:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Amersly

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2016-12-08 15:24:30
确定输入文件都没有错？

输入文件如下：
&CONTROL
                 calculation = 'scf' ,
                 restart_mode  = 'from_scratch',
                      outdir = '/home/luyaosong/QE/qe-6.0/bin/mos2/' ,
                  pseudo_dir = '/home/luyaosong/QE/qe-6.0/bin/mos2/' ,
                      prefix = 'mos2' ,
/
&SYSTEM
                      ibrav       = 4,
                     celldm(1)   = 5.9716,
                      celldm(3)   = 12,
                      nat         = 3,
                      ntyp        = 2,
                      ecutwfc     = 50,
                      ecutrho     = 410,
                        nbnd = 8,
            exxdiv_treatment = 'gygi-baldereschi' ,
/
&ELECTRONS
                    conv_thr = 1.0d-10 ,
/
ATOMIC_SPECIES
Mo  95.94    Mo.pz-spn-rrkjus_psl.0.2.UPF
S   32.066   S.pz-n-rrkjus_psl.0.1.UPF
ATOMIC_POSITIONS (alat)
S        0.500000000   0.288675130   1.974192764
Mo       0.000000000   0.577350270   2.462038339
S        0.000000000  -0.577350270   2.950837559
K_POINTS automatic
16 16 1 0 0 0

求指点！
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3楼2016-12-09 16:03:46
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wode147

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我也做过这个，&control
    calculation = 'relax',
    prefix='MoS2',
    pseudo_dir='/home/ g/Code/espresso-5.1.1/pseudo'
    outdir = './tmp',
    nstep = 200,
    tstress = .true.,
    tprnfor = .true.,
    etot_conv_thr = 1.0D-4,
    forc_conv_thr = 1.0D-3,
/
&system   
    ibrav=  4, celldm(1) = 5.97153455363,  celldm(3)= 10,
    nat=  3, ntyp= 2,
    ecutwfc = 80.0,
    ecutrho = 600,
    occupations = 'smearing',
    smearing = 'gaussian',
    degauss = 1.d-8,
/
&electrons
    conv_thr = 1.d-10
/
&ions
    ion_dynamics = 'bfgs'
/
&cell
    cell_dynamics = 'bfgs'
/
ATOMIC_SPECIES
Mo  95.94   Mo.pbe-spn-kjpaw_psl.0.3.0.UPF
S   32.065  S.pbe-n-kjpaw_psl.0.1.UPF
ATOMIC_POSITIONS
S  0.00 0.57735026919  3.4982879746835  
Mo 0.00 0.00000000000  4.00000000000
S  0.00 0.57735026919  4.5017120253165  
K_POINTS automatic
15  15  1  0  0  0
这是我的优化文件，你看一下吧，自洽在另一个电脑上不方便，优化和自洽也差不多，你对比一下吧
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4楼2016-12-09 17:47:39
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