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shuting1994

新虫 (小有名气)

[求助] 建立氮化硼模型但是dump出来的结构却是碳原子石墨烯结构怎么回事? 已有2人参与

这是我的结构建模:
atom_style atomic
lattice custom 4.35 a1 1 0 0 a2 0 0.57735 0 a3 0 0 10 basis 0.167 0.25 0.5 basis 0.33 0.75 0.5 basis 0.67 0.75 0.5 basis 0.83 0.25 0.5
region box block 0 30 0 400 0 45 units box
create_box 2 box
mass 1 10
mass 2 14
create_atoms 2 region box basis 1 2 basis 2 1 basis 3 1 basis 4 2
pair_style tersoff
pair_coeff * *BNC B N
以上是建模,按道理氮化硼就是把石墨烯的碳原子换成交替的氮和硼,所以我在石墨烯的lattice custom基础上定义了2种原子,并且给出氮和硼质量,pair_style 取BNC.tersoff中的B和N,可是为什么dump原子信息一直就只有一种原子,并且显示是碳呢?哪位高手知道?非常感谢!

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futao1203

木虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by 相恒高 at 2017-02-10 00:31:44
***********************************(本人申请,内容屏蔽)*************************

他做二维的,用这个势函数可以。

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13楼2017-02-13 08:58:27
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
pair_style tersoff  

这个tersoff是按C来写的吧

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2016-12-08 13:50:01
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shuting1994

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by gredream at 2016-12-08 12:15:34
dump怎么写的?

我写dump 1 all custom 5000 bn.lammpstrj id element x y z的时候,输出id element x y x分别是  1(2 3 ……) C(一直显示C)  x的坐标 y的坐标 z的坐标,而当我写dump 1 all atom  1 bn.lammpstrj输出,id type xs ys zs 分别是1(2 3 ……) 1(此处1 2交换) x分子坐标 y 分子坐标 z分子坐标 虽然dump atom好像有2个type但是再看质量,都是输出的12,就算他有2个type ,也都是碳原子的意思,很苦恼,改了好长时间了,没有找出问题在哪

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4楼2016-12-08 14:12:56
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shuting1994

新虫 (小有名气)

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引用回帖:
3楼: Originally posted by abinitio at 2016-12-08 13:50:01
pair_style tersoff  

这个tersoff是按C来写的吧

啊!原来是这样吗,我也看了手册里pair_coeff命令那块,实在没有找到问题,请问这种BCN三原子势函数,我只想取B和N应该怎么定义呢?

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5楼2016-12-08 14:15:24
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