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shuting1994新虫 (小有名气)
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建立氮化硼模型但是dump出来的结构却是碳原子石墨烯结构怎么回事？ 已有2人参与
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这是我的结构建模： atom_style atomic lattice custom 4.35 a1 1 0 0 a2 0 0.57735 0 a3 0 0 10 basis 0.167 0.25 0.5 basis 0.33 0.75 0.5 basis 0.67 0.75 0.5 basis 0.83 0.25 0.5 region box block 0 30 0 400 0 45 units box create_box 2 box mass 1 10 mass 2 14 create_atoms 2 region box basis 1 2 basis 2 1 basis 3 1 basis 4 2 pair_style tersoff pair_coeff * *BNC B N 以上是建模，按道理氮化硼就是把石墨烯的碳原子换成交替的氮和硼，所以我在石墨烯的lattice custom基础上定义了2种原子，并且给出氮和硼质量，pair_style 取BNC.tersoff中的B和N，可是为什么dump原子信息一直就只有一种原子，并且显示是碳呢？哪位高手知道？非常感谢！ 发自小木虫Android客户端 |
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我写dump 1 all custom 5000 bn.lammpstrj id element x y z的时候，输出id element x y x分别是 1(2 3 ……) C(一直显示C) x的坐标 y的坐标 z的坐标，而当我写dump 1 all atom 1 bn.lammpstrj输出，id type xs ys zs 分别是1(2 3 ……) 1(此处1 2交换) x分子坐标 y 分子坐标 z分子坐标 虽然dump atom好像有2个type但是再看质量，都是输出的12，就算他有2个type ，也都是碳原子的意思，很苦恼，改了好长时间了，没有找出问题在哪 发自小木虫Android客户端 |
4楼2016-12-08 14:12:56
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6楼2016-12-08 14:28:26
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谢谢！我试了改成你说的，直接报错了，我又想，如果是tersoff问题，我直接把tersoff文件里含碳的部分全删了，结果输出的还是碳原子，觉得可能是前面结构部分出问题了，但是又找不到，打算学ms去了，借用其他软件建模生成data试试 发自小木虫Android客户端 |
7楼2016-12-08 14:59:23
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pair_coeff * *BNC B N 这种没有..tersoff 的不错？你将BNC.tersoff文件改名字了？ 那在pair_coeff * *BNC B N C呢？就是把C也加到后面 |
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8楼2016-12-08 15:18:38
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没有改名字，我先试了下pair_coeff * * BNC.tersoff B N C 直接报错了，然后我以文本格式打开BNC.tersoff，把含有碳的势函数全部删除了，文件的名字没有改变，此时运行出来的结构依然是石墨烯的 发自小木虫Android客户端 |
9楼2016-12-08 15:26:09
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10楼2016-12-10 20:24:07