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zxt1222

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[求助] 关于复合物中甲酰胺氢键作用力

请教一个成氢键的问题
在晶体复合物中蛋白的ASN的甲酰胺上的氨基，周边观察到有3个可以成氢键的基团：
1）2个羰基的氧，距离为2.8埃 2）一个吡唑的氮原子，距离为2.6埃

在单晶中的蛋白不加氢的情况下，几个软件都认为，吡唑的氮原子作为氢键受体形成1个氢键

但是加氢之后，多个软件又会认为，甲酰胺上的氨基同时合2个羰基形成氢键，而和吡唑的氮原子不成氢键

这种情况下，如何加氢比较合理？怎么判断其作用力？

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1楼 2016-12-07 21:03:38

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