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关于复合物中甲酰胺氢键作用力
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请教一个成氢键的问题 在晶体复合物中蛋白的ASN的甲酰胺上的氨基,周边观察到有3个可以成氢键的基团: 1)2个羰基的氧,距离为2.8埃 2)一个吡唑的氮原子,距离为2.6埃 在单晶中的蛋白不加氢的情况下,几个软件都认为,吡唑的氮原子作为氢键受体形成1个氢键 但是加氢之后,多个软件又会认为,甲酰胺上的氨基同时合2个羰基形成氢键,而和吡唑的氮原子不成氢键 这种情况下,如何加氢比较合理? 怎么判断其作用力? |
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