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阿娜依

银虫 (小有名气)

[求助] 有机分子设计 已有1人参与

1.  我现在有一个小分子结构A，要进行分子设计，就是要再找一个B或多个小分子进行对接，那么找的分子B的原则是怎样的？？？
2. 怎么判断一个化合物分子的活性位点，不知道对接的时候会上到哪里去？？
谢谢各位大神能够分享一下！！@smutao@oxox6085
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活得像自己
1楼 2016-12-02 20:40:46
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阿娜依

银虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by autodockytu at 2016-12-03 15:27:23
反向分子对接找到靶点，再进行正向的构效关系分析；或者选定靶点，进行特定方向改造

谢谢，但是我怎样知道对接的位点呢，还有我找另一个分子的原则是怎样的，就是取代原子，取代基对原来分子的物理化学性质的改变，不是很清楚？？还望指教一下！！

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活得像自己
3楼2016-12-04 10:46:43
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autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
反向分子对接找到靶点，再进行正向的构效关系分析；或者选定靶点，进行特定方向改造
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阿娜依
2楼2016-12-03 15:27:23
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changjun

铜虫 (著名写手)
对接的位点无非以下几条：1，根据蛋白晶体中的配体；2.文献；3，软件自动搜索蛋白中的空腔。

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天然产物、药物开发
4楼2016-12-04 11:42:35
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阿娜依

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by changjun at 2016-12-04 11:42:35
对接的位点无非以下几条：1，根据蛋白晶体中的配体；2.文献；3，软件自动搜索蛋白中的空腔。

谢谢，我做的是有机合成，我讲的是化合物分子的进攻点，就是容易被替代的位点！！！哈哈

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活得像自己
5楼2016-12-04 23:01:35
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