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阿娜依

银虫 (小有名气)

[求助] 有机分子设计 已有1人参与

1.  我现在有一个小分子结构A,要进行分子设计,就是要再找一个B或多个小分子进行对接,那么找的分子B的原则是怎样的???
2. 怎么判断一个化合物分子的活性位点,不知道对接的时候会上到哪里去??
谢谢各位大神能够分享一下!!@smutao@oxox6085
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活得像自己
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autodockytu

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【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
反向分子对接找到靶点,再进行正向的构效关系分析;或者选定靶点,进行特定方向改造

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2016-12-03 15:27:23
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阿娜依

银虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by autodockytu at 2016-12-03 15:27:23
反向分子对接找到靶点,再进行正向的构效关系分析;或者选定靶点,进行特定方向改造

谢谢,但是我怎样知道对接的位点呢,还有我找另一个分子的原则是怎样的,就是取代原子,取代基对原来分子的物理化学性质的改变,不是很清楚??还望指教一下!!

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活得像自己
3楼2016-12-04 10:46:43
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changjun

铜虫 (著名写手)

对接的位点无非以下几条:1,根据蛋白晶体中的配体;2.文献;3,软件自动搜索蛋白中的空腔。

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天然产物、药物开发
4楼2016-12-04 11:42:35
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阿娜依

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by changjun at 2016-12-04 11:42:35
对接的位点无非以下几条:1,根据蛋白晶体中的配体;2.文献;3,软件自动搜索蛋白中的空腔。

谢谢,我做的是有机合成,我讲的是化合物分子的进攻点,就是容易被替代的位点!!!哈哈

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活得像自己
5楼2016-12-04 23:01:35
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