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高性能计算提交abaqus的job问题
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各位虫友你们好,鄙人最近想使用学校的高性能计算中心的abaqus(需要调用自编的用户子程序vumat),但是不知道如何修改abaqus.pbs脚本文件,请熟悉这问题的虫友指点一二,谢谢,谢谢。 PS:以下是abaqus.pbs脚本的代码: #!/bin/sh ################################################################# #PBS -N Abaqus #PBS -l nodes=2:ppn=16 #PBS -l walltime=4:00:00 #PBS -q batch #PBS -V #PBS -S /bin/bash ################################################################# EXEC=/export/software/abaqus/Commands/abaqus ##To be modified by users## ARGS="beam" cd $PBS_O_WORKDIR NP=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l` cat $PBS_NODEFILE > /tmp/nodefile.$$ sed -e 's\c\ibc\g' -i /tmp/nodefile.$$ #$PARA -genv I_MPI_DEVICE ssm -hostfile /tmp/nodefile.$$ -np $NP $EXEC $ARGS mp_host_list="[" for n in $(sort -u $PBS_NODEFILE);do mp_host_list="${mp_host_list}['$n',$(grep -c $n $PBS_NODEFILE)]," done mp_host_list=$(echo ${mp_host_list} | sed -e "s/,$/]/" ![]() cat > abaqus_v6.env<<'EOF' ask_delete=OFF EOF echo "mp_host_list=${mp_host_list}" >> abaqus_v6.env # Run the job #$EXEC mp_mode=threads cpus=$NP job=$ARGS input=$ARGS.inp $EXEC mp_mode=mpi cpus=$NP job=$ARGS input=$ARGS.inp interactive #del tmp files rm -rf /tmp/nodefile.$$ |
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